56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2221 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2221  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 375 aa  769    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139161  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3682  hypothetical protein  68.72 
 
 		 375 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1797  hypothetical protein  65.32 
 
 		 375 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0455083  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  35.85 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1138  putative transmembrane protein  35.66 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2343  saccharopine dehydrogenase  32.45 
 
 		 376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03325  saccharopine dehydrogenase  34.07 
 
 		 457 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0669  Saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 		 577 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0723  Saccharopine dehydrogenase  32.36 
 
 		 574 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4536  saccharopine dehydrogenase  31.97 
 
 		 557 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.802227  normal  0.151907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4996  Saccharopine dehydrogenase  31.32 
 
 		 554 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0108  saccharopine dehydrogenase  30.13 
 
 		 550 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.566304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5049  Saccharopine dehydrogenase  30.42 
 
 		 554 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4779  saccharopine dehydrogenase  32.46 
 
 		 553 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3620  saccharopine dehydrogenase  30.67 
 
 		 527 aa  103  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00695172 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  22.84 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  26.52 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  28.83 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  28.83 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  31.21 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  23.88 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3672  saccharopine dehydrogenase  25.27 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.420648 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2300  Saccharopine dehydrogenase  27.45 
 
 		 408 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0134168  hitchhiker  0.00267876 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  26.36 
 
 		 350 aa  53.5  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  28.47 
 
 		 352 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1105  Saccharopine dehydrogenase  28.93 
 
 		 422 aa  51.6  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  30.14 
 
 		 454 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3084  Saccharopine dehydrogenase  28.47 
 
 		 352 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0007  saccharopine dehydrogenase  22.02 
 
 		 387 aa  50.4  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  24.23 
 
 		 351 aa  50.4  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0020  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  25.45 
 
 		 390 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_7  hypothetical protein  21.1 
 
 		 387 aa  50.1  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3058  saccharopine dehydrogenase  32.08 
 
 		 348 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  28.47 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5529  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  29.59 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_002936  DET0007  hypothetical protein  21.43 
 
 		 387 aa  47  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.870936  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0541  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  29.45 
 
 		 414 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0138  saccharopine dehydrogenase  24.5 
 
 		 432 aa  47  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  26.67 
 
 		 385 aa  47  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  25 
 
 		 360 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56730  hypothetical protein  27.67 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07293  conserved hypothetical protein  25.56 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.087222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4933  hypothetical protein  28.48 
 
 		 352 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  23.46 
 
 		 367 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3626  saccharopine dehydrogenase  25.66 
 
 		 410 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  24.02 
 
 		 367 aa  43.9  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0129  hypothetical protein  24.5 
 
 		 432 aa  43.9  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.150233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2039  Saccharopine dehydrogenase  31.06 
 
 		 409 aa  43.9  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4764  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  29.86 
 
 		 410 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1339  Saccharopine dehydrogenase  27.86 
 
 		 343 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  28.85 
 
 		 422 aa  43.1  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2140  saccharopine dehydrogenase  27.06 
 
 		 389 aa  43.1  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0770  saccharopine dehydrogenase  31.33 
 
 		 335 aa  42.7  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5854  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  27.22 
 
 		 419 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  24.85 
 
 		 402 aa  43.1  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  28.36 
 
 		 376 aa  42.7  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>