38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0723 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0723  Saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 574 aa  1126    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0669  Saccharopine dehydrogenase  81.08 
 
 		 577 aa  878    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5049  Saccharopine dehydrogenase  39.13 
 
 		 554 aa  270  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4536  saccharopine dehydrogenase  39.9 
 
 		 557 aa  269  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.802227  normal  0.151907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4996  Saccharopine dehydrogenase  40.03 
 
 		 554 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4779  saccharopine dehydrogenase  38.28 
 
 		 553 aa  259  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1138  putative transmembrane protein  38.76 
 
 		 375 aa  204  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3620  saccharopine dehydrogenase  33.22 
 
 		 527 aa  189  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00695172 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0108  saccharopine dehydrogenase  33.57 
 
 		 550 aa  187  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.566304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  31.76 
 
 		 371 aa  187  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2343  saccharopine dehydrogenase  30.81 
 
 		 376 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3682  hypothetical protein  33.16 
 
 		 375 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2221  saccharopine dehydrogenase  32.8 
 
 		 375 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1797  hypothetical protein  32.8 
 
 		 375 aa  153  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0455083  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03325  saccharopine dehydrogenase  31.47 
 
 		 457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2884  hypothetical protein  36.99 
 
 		 176 aa  82.8  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04871  hypothetical protein  36.57 
 
 		 176 aa  78.6  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1076  hypothetical protein  33.14 
 
 		 181 aa  77.8  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0980  hypothetical protein  32.56 
 
 		 181 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal  0.0628695 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2482  hypothetical protein  32.54 
 
 		 172 aa  76.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.470104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3456  hypothetical protein  33.91 
 
 		 174 aa  72.8  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.316596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3157  hypothetical protein  36.36 
 
 		 174 aa  68.2  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1137  hypothetical protein  33.53 
 
 		 180 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  22.78 
 
 		 369 aa  63.5  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  29.61 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  21.67 
 
 		 384 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0007  saccharopine dehydrogenase  27.75 
 
 		 387 aa  50.8  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0007  hypothetical protein  25.13 
 
 		 387 aa  48.5  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.870936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1814  hypothetical protein  22.96 
 
 		 201 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.075678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1679  hypothetical protein  22.96 
 
 		 201 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1859  hypothetical protein  22.96 
 
 		 201 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13439e-35 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_7  hypothetical protein  24.62 
 
 		 387 aa  47.4  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3010  hypothetical protein  41.67 
 
 		 87 aa  47.4  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  23.81 
 
 		 367 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1625  hypothetical protein  22.96 
 
 		 201 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.835546  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4609  hypothetical protein  28.79 
 
 		 392 aa  45.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.856643  normal  0.0914614 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1935  hypothetical protein  22.96 
 
 		 201 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000839063  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0020  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  27.85 
 
 		 390 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>