15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1137 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1137  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  359  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0980  hypothetical protein  76.88 
 
 		 181 aa  267  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal  0.0628695 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1076  hypothetical protein  76.88 
 
 		 181 aa  265  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2884  hypothetical protein  32.56 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5049  Saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 		 554 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2482  hypothetical protein  28.74 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.470104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4779  saccharopine dehydrogenase  31.95 
 
 		 553 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4536  saccharopine dehydrogenase  30.86 
 
 		 557 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.802227  normal  0.151907 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3157  hypothetical protein  32.95 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04871  hypothetical protein  32.58 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3456  hypothetical protein  31.03 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.316596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0723  Saccharopine dehydrogenase  33.53 
 
 		 574 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4996  Saccharopine dehydrogenase  30.86 
 
 		 554 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1215  hypothetical protein  27.97 
 
 		 233 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.932644  normal  0.206964 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3620  saccharopine dehydrogenase  25.88 
 
 		 527 aa  45.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00695172 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>