17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3157 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3157  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  343  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04871  hypothetical protein  60 
 
 		 176 aa  187  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4779  saccharopine dehydrogenase  37.28 
 
 		 553 aa  84.3  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0980  hypothetical protein  32.35 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal  0.0628695 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1076  hypothetical protein  32.35 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4536  saccharopine dehydrogenase  35.39 
 
 		 557 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.802227  normal  0.151907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4996  Saccharopine dehydrogenase  35.96 
 
 		 554 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5049  Saccharopine dehydrogenase  33.9 
 
 		 554 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1137  hypothetical protein  32.95 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0108  saccharopine dehydrogenase  33.52 
 
 		 550 aa  65.1  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.566304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0669  Saccharopine dehydrogenase  35.03 
 
 		 577 aa  61.6  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0723  Saccharopine dehydrogenase  35.8 
 
 		 574 aa  60.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3456  hypothetical protein  27.33 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.316596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3620  saccharopine dehydrogenase  29.07 
 
 		 527 aa  57  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00695172 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2884  hypothetical protein  29.89 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2482  hypothetical protein  23.53 
 
 		 172 aa  52  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.470104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1215  hypothetical protein  27.74 
 
 		 233 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.932644  normal  0.206964 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>