34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0669 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0723  Saccharopine dehydrogenase  80.73 
 
 		 574 aa  859    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0669  Saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 577 aa  1120    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5049  Saccharopine dehydrogenase  39.93 
 
 		 554 aa  280  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4536  saccharopine dehydrogenase  39.76 
 
 		 557 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.802227  normal  0.151907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4779  saccharopine dehydrogenase  39.69 
 
 		 553 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4996  Saccharopine dehydrogenase  40.17 
 
 		 554 aa  270  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1138  putative transmembrane protein  38.68 
 
 		 375 aa  213  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0108  saccharopine dehydrogenase  34.72 
 
 		 550 aa  210  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.566304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3620  saccharopine dehydrogenase  34.32 
 
 		 527 aa  193  7e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00695172 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  32.88 
 
 		 371 aa  187  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2343  saccharopine dehydrogenase  31.43 
 
 		 376 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3682  hypothetical protein  34.29 
 
 		 375 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2221  saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 		 375 aa  160  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1797  hypothetical protein  32.8 
 
 		 375 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0455083  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03325  saccharopine dehydrogenase  31.79 
 
 		 457 aa  133  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04871  hypothetical protein  36.11 
 
 		 176 aa  76.6  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0980  hypothetical protein  35.03 
 
 		 181 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal  0.0628695 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3157  hypothetical protein  35.03 
 
 		 174 aa  73.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1076  hypothetical protein  34.46 
 
 		 181 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3456  hypothetical protein  32.96 
 
 		 174 aa  71.2  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.316596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2482  hypothetical protein  29.48 
 
 		 172 aa  68.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.470104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2884  hypothetical protein  32.02 
 
 		 176 aa  65.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  24.07 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1137  hypothetical protein  32.22 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  23.1 
 
 		 384 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  27.63 
 
 		 378 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0007  saccharopine dehydrogenase  28.78 
 
 		 387 aa  52.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0007  hypothetical protein  27.09 
 
 		 387 aa  49.7  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.870936  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  25.83 
 
 		 367 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3010  hypothetical protein  43.75 
 
 		 87 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_7  hypothetical protein  26.11 
 
 		 387 aa  47  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1814  hypothetical protein  21.94 
 
 		 201 aa  44.3  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.075678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1679  hypothetical protein  21.94 
 
 		 201 aa  44.3  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1859  hypothetical protein  21.94 
 
 		 201 aa  43.5  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13439e-35 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>