36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03325 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03325  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 457 aa  913    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  39.94 
 
 		 371 aa  252  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2343  saccharopine dehydrogenase  37.37 
 
 		 376 aa  241  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1138  putative transmembrane protein  41.55 
 
 		 375 aa  232  9e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5049  Saccharopine dehydrogenase  41.85 
 
 		 554 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4996  Saccharopine dehydrogenase  40.98 
 
 		 554 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4536  saccharopine dehydrogenase  40.76 
 
 		 557 aa  207  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.802227  normal  0.151907 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1797  hypothetical protein  34.97 
 
 		 375 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0455083  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2221  saccharopine dehydrogenase  34.14 
 
 		 375 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139161  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3682  hypothetical protein  35.87 
 
 		 375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0108  saccharopine dehydrogenase  36.12 
 
 		 550 aa  163  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.566304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4779  saccharopine dehydrogenase  35.79 
 
 		 553 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3620  saccharopine dehydrogenase  35.89 
 
 		 527 aa  144  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00695172 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0669  Saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 		 577 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0723  Saccharopine dehydrogenase  30.18 
 
 		 574 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  25.62 
 
 		 384 aa  99.8  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  26.21 
 
 		 367 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  24.23 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  22.7 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  27.5 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  29.88 
 
 		 454 aa  53.9  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1148  saccharopine dehydrogenase  36.54 
 
 		 325 aa  51.2  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1038  saccharopine dehydrogenase  38.46 
 
 		 325 aa  50.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.264702 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  29.81 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  34.03 
 
 		 376 aa  49.3  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40135  predicted protein  30.21 
 
 		 461 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  31.5 
 
 		 350 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  22.83 
 
 		 403 aa  46.6  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  35.56 
 
 		 365 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  29.49 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  22.93 
 
 		 392 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54890  hypothetical protein  27.22 
 
 		 634 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000285931  unclonable  1.9973799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  29.49 
 
 		 367 aa  43.9  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  21.95 
 
 		 403 aa  43.9  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  22.45 
 
 		 404 aa  43.9  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  23.36 
 
 		 405 aa  43.1  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>