16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_54890 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_54890  hypothetical protein  100 
 
 		 634 aa  1308    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000285931  unclonable  1.9973799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  23.56 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  22.76 
 
 		 384 aa  53.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  24.66 
 
 		 378 aa  52.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1148  saccharopine dehydrogenase  25.94 
 
 		 325 aa  52.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  22 
 
 		 369 aa  48.5  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2343  saccharopine dehydrogenase  26.8 
 
 		 376 aa  48.5  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3682  hypothetical protein  24.52 
 
 		 375 aa  47.4  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1138  putative transmembrane protein  30 
 
 		 375 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  21.58 
 
 		 376 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1038  saccharopine dehydrogenase  23.45 
 
 		 325 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.264702 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  28.57 
 
 		 415 aa  44.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0538  saccharopine dehydrogenase  27.54 
 
 		 394 aa  44.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  25.5 
 
 		 454 aa  43.9  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0966  saccharopine dehydrogenase  24.37 
 
 		 394 aa  43.9  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.287353  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  33.11 
 
 		 348 aa  43.9  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>