27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_40135 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_40135  predicted protein  100 
 
 		 461 aa  948    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  38.83 
 
 		 454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  28.9 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  28.42 
 
 		 384 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  28.61 
 
 		 376 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  25.75 
 
 		 369 aa  124  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36377  predicted protein  28.57 
 
 		 413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  26.39 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2343  saccharopine dehydrogenase  30.67 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  26.28 
 
 		 415 aa  56.6  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1148  saccharopine dehydrogenase  29.19 
 
 		 325 aa  54.7  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1797  hypothetical protein  27.95 
 
 		 375 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0455083  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3682  hypothetical protein  27.95 
 
 		 375 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54890  hypothetical protein  29.3 
 
 		 634 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000285931  unclonable  1.9973799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1038  saccharopine dehydrogenase  29.19 
 
 		 325 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.264702 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  29.66 
 
 		 371 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  28.39 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0685  saccharopine dehydrogenase  27.1 
 
 		 356 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0753  saccharopine dehydrogenase  27.1 
 
 		 356 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03325  saccharopine dehydrogenase  32.8 
 
 		 457 aa  47.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  23.38 
 
 		 376 aa  47.8  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4494  saccharopine dehydrogenase  26.8 
 
 		 343 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3620  saccharopine dehydrogenase  27.64 
 
 		 527 aa  46.6  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00695172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  33.78 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1138  putative transmembrane protein  27.06 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  27.74 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  26.61 
 
 		 405 aa  43.5  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>