34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0007 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0007  hypothetical protein  91.21 
 
 		 387 aa  748    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.870936  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_7  hypothetical protein  91.71 
 
 		 387 aa  750    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0007  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 387 aa  805    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  22.44 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  21.37 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4536  saccharopine dehydrogenase  25.5 
 
 		 557 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.802227  normal  0.151907 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  30.71 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2343  saccharopine dehydrogenase  22.86 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  27.89 
 
 		 367 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5049  Saccharopine dehydrogenase  24.29 
 
 		 554 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4996  Saccharopine dehydrogenase  28.7 
 
 		 554 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  24.18 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0669  Saccharopine dehydrogenase  28.78 
 
 		 577 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2221  saccharopine dehydrogenase  22.02 
 
 		 375 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0723  Saccharopine dehydrogenase  27.75 
 
 		 574 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 		 377 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00494367  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0108  saccharopine dehydrogenase  23.23 
 
 		 550 aa  50.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.566304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  25.95 
 
 		 376 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  28.22 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1038  saccharopine dehydrogenase  28.31 
 
 		 325 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.264702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  29.45 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54900  hypothetical protein  30.94 
 
 		 384 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000637066  unclonable  7.39539e-22 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  20.78 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  27.61 
 
 		 367 aa  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5612  saccharopine dehydrogenase  32.38 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1148  saccharopine dehydrogenase  28.99 
 
 		 325 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1138  putative transmembrane protein  23.78 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  25.17 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  26.22 
 
 		 398 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2081  saccharopine dehydrogenase  30.43 
 
 		 371 aa  43.1  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.484567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1797  hypothetical protein  24.1 
 
 		 375 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0455083  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  26.99 
 
 		 362 aa  43.1  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  26.99 
 
 		 362 aa  43.1  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  27.54 
 
 		 748 aa  42.7  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>