30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0007 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_7  hypothetical protein  95.08 
 
 
387 aa  776    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0007  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  806    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.870936  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0007  saccharopine dehydrogenase  91.21 
 
 
387 aa  748    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4536  saccharopine dehydrogenase  25.71 
 
 
557 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.802227  normal  0.151907 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  22.47 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  22.92 
 
 
371 aa  63.5  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5049  Saccharopine dehydrogenase  24.86 
 
 
554 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4996  Saccharopine dehydrogenase  24.43 
 
 
554 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  29.45 
 
 
367 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2343  saccharopine dehydrogenase  22.3 
 
 
376 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  24.16 
 
 
376 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  29.29 
 
 
454 aa  53.9  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  20.05 
 
 
384 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1138  putative transmembrane protein  22.44 
 
 
375 aa  53.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0108  saccharopine dehydrogenase  25.24 
 
 
550 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.566304  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1038  saccharopine dehydrogenase  28.57 
 
 
325 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.264702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  21.43 
 
 
378 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 
377 aa  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00494367  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0669  Saccharopine dehydrogenase  27.09 
 
 
577 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986243  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0723  Saccharopine dehydrogenase  25.13 
 
 
574 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554623  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54900  hypothetical protein  30.66 
 
 
384 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000637066  unclonable  7.39539e-22 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2221  saccharopine dehydrogenase  21.43 
 
 
375 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139161  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  28.83 
 
 
367 aa  47  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1148  saccharopine dehydrogenase  28.57 
 
 
325 aa  47  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  26.99 
 
 
367 aa  46.2  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2081  saccharopine dehydrogenase  25.71 
 
 
371 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.484567  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  26.22 
 
 
398 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  27.61 
 
 
373 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5612  saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 
362 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  25.9 
 
 
415 aa  43.5  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>