22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_54900 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_54900  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  783    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000637066  unclonable  7.39539e-22 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  24.26 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0685  saccharopine dehydrogenase  25.21 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  24.32 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00494367  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0753  saccharopine dehydrogenase  24.93 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  21.84 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  30.22 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2081  saccharopine dehydrogenase  27.72 
 
 		 371 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.484567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2645  saccharopine dehydrogenase  27.07 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00207911  normal  0.116194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  20.16 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2673  Saccharopine dehydrogenase  28.66 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0130608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3964  Saccharopine dehydrogenase  24.72 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5296  saccharopine dehydrogenase  25.29 
 
 		 351 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.813788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3474  saccharopine dehydrogenase  24.14 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_7  hypothetical protein  23.86 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0007  saccharopine dehydrogenase  30.94 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0007  hypothetical protein  30.66 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.870936  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2819  saccharopine dehydrogenase  32.4 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1148  saccharopine dehydrogenase  31.82 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 366 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.122533  hitchhiker  0.00990126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1038  saccharopine dehydrogenase  30.26 
 
 		 325 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.264702 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>