45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2645 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2645  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 368 aa  728    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00207911  normal  0.116194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2081  saccharopine dehydrogenase  81.59 
 
 		 371 aa  552  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.484567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.83 
 
 		 377 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00494367  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2819  saccharopine dehydrogenase  36.19 
 
 		 358 aa  143  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2673  Saccharopine dehydrogenase  30.85 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0130608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3768  hypothetical protein  39.21 
 
 		 480 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.78 
 
 		 366 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.122533  hitchhiker  0.00990126 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0753  saccharopine dehydrogenase  28.61 
 
 		 356 aa  103  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0685  saccharopine dehydrogenase  28.31 
 
 		 356 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3964  Saccharopine dehydrogenase  28.34 
 
 		 360 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54900  hypothetical protein  27.13 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000637066  unclonable  7.39539e-22 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  22.4 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  34 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  25.71 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  31.21 
 
 		 363 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  23.9 
 
 		 376 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  24.5 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1038  saccharopine dehydrogenase  31.72 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.264702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2343  saccharopine dehydrogenase  33.1 
 
 		 376 aa  50.1  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  24.66 
 
 		 369 aa  49.7  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  33 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1135  Saccharopine dehydrogenase  32.71 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1148  saccharopine dehydrogenase  30.57 
 
 		 325 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  33.77 
 
 		 454 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4494  saccharopine dehydrogenase  33.87 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5296  saccharopine dehydrogenase  30.2 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.813788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1797  hypothetical protein  33.33 
 
 		 375 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0455083  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  29.22 
 
 		 371 aa  47  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  28.27 
 
 		 397 aa  46.2  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3474  saccharopine dehydrogenase  29.35 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  28.82 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41409  predicted protein  25 
 
 		 1506 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.974379  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.349709 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1404  saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_002936  DET0007  hypothetical protein  24.67 
 
 		 387 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.870936  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_7  hypothetical protein  25.17 
 
 		 387 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  31.39 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 251 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 		 247 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3682  hypothetical protein  31 
 
 		 375 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0007  saccharopine dehydrogenase  25.17 
 
 		 387 aa  43.5  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  28.82 
 
 		 398 aa  43.5  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  26.92 
 
 		 398 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14900  saccharopine dehydrogenase-like oxidoreductase  28.23 
 
 		 313 aa  43.1  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00802223  normal  0.0704992 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 229 aa  43.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>