43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1760 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 366 aa  686    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.122533  hitchhiker  0.00990126 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.78 
 
 		 377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00494367  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3768  hypothetical protein  44.58 
 
 		 480 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2819  saccharopine dehydrogenase  42.57 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2081  saccharopine dehydrogenase  40.68 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.484567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2673  Saccharopine dehydrogenase  28.23 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0130608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0685  saccharopine dehydrogenase  28.87 
 
 		 356 aa  109  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2645  saccharopine dehydrogenase  39.61 
 
 		 368 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00207911  normal  0.116194 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0753  saccharopine dehydrogenase  29.13 
 
 		 356 aa  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3964  Saccharopine dehydrogenase  28.88 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54900  hypothetical protein  30.69 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000637066  unclonable  7.39539e-22 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1038  saccharopine dehydrogenase  37.65 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.264702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1148  saccharopine dehydrogenase  35.88 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  32.21 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.68 
 
 		 213 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  25.81 
 
 		 367 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  23.08 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.9 
 
 		 203 aa  51.2  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1973  Saccharopine dehydrogenase  36.97 
 
 		 304 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000865351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5517  hypothetical protein  36.19 
 
 		 203 aa  50.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  27.27 
 
 		 376 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  27.89 
 
 		 384 aa  49.7  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  40.2 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6607  saccharopine dehydrogenase  40.43 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  30.49 
 
 		 454 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4232  hypothetical protein  30.43 
 
 		 203 aa  47  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.71 
 
 		 227 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08970  oxidoreductase CipA-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12460)  34.44 
 
 		 297 aa  46.6  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000000202383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.44 
 
 		 210 aa  46.6  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112317  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2820  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.21 
 
 		 329 aa  46.2  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0203208  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.23 
 
 		 214 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  38.36 
 
 		 213 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  30 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1135  Saccharopine dehydrogenase  33.67 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.25 
 
 		 209 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.44 
 
 		 210 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4779  saccharopine dehydrogenase  32.54 
 
 		 553 aa  43.1  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 		 204 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.44 
 
 		 210 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.692938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  42.86 
 
 		 512 aa  43.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.11 
 
 		 214 aa  43.1  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 		 204 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2522  hypothetical protein  32.74 
 
 		 203 aa  43.1  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>