45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1973 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1973  Saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 304 aa  586  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000865351  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1148  saccharopine dehydrogenase  52.38 
 
 		 325 aa  279  5e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1038  saccharopine dehydrogenase  54.11 
 
 		 325 aa  269  5e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.264702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1168  hypothetical protein  52.26 
 
 		 202 aa  155  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14900  saccharopine dehydrogenase-like oxidoreductase  38 
 
 		 313 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00802223  normal  0.0704992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  27.43 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  27 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  26.81 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0190  Saccharopine dehydrogenase and related protein- like protein  29.66 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  25.85 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  29.05 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  25.56 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  36.11 
 
 		 454 aa  59.7  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  28.11 
 
 		 398 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  26.17 
 
 		 360 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  33.59 
 
 		 748 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  33.1 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  34.25 
 
 		 348 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54900  hypothetical protein  30.07 
 
 		 384 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000637066  unclonable  7.39539e-22 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1138  putative transmembrane protein  26.56 
 
 		 375 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0685  saccharopine dehydrogenase  32.35 
 
 		 356 aa  46.2  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 		 366 aa  45.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.122533  hitchhiker  0.00990126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4494  saccharopine dehydrogenase  27.27 
 
 		 343 aa  45.8  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  31.07 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  25.12 
 
 		 400 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0753  saccharopine dehydrogenase  32.35 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0007  hypothetical protein  23.61 
 
 		 387 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.870936  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  31.03 
 
 		 346 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2645  saccharopine dehydrogenase  29.29 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00207911  normal  0.116194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6607  saccharopine dehydrogenase  34.91 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2081  saccharopine dehydrogenase  30.26 
 
 		 371 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.484567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.78 
 
 		 215 aa  44.3  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  31.87 
 
 		 385 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  34.25 
 
 		 347 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0007  saccharopine dehydrogenase  26.72 
 
 		 387 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  31.82 
 
 		 345 aa  43.5  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5612  saccharopine dehydrogenase  22.55 
 
 		 362 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  32.79 
 
 		 354 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.11 
 
 		 283 aa  42.7  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.45 
 
 		 214 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3620  saccharopine dehydrogenase  28.96 
 
 		 527 aa  42.7  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00695172 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  26.47 
 
 		 394 aa  42.7  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2209  hypothetical protein  25.88 
 
 		 514 aa  42.7  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_7  hypothetical protein  24.35 
 
 		 387 aa  42.7  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  37.14 
 
 		 281 aa  42.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>