25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2819 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2819  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 358 aa  684    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.55 
 
 		 377 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00494367  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2645  saccharopine dehydrogenase  37.69 
 
 		 368 aa  153  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00207911  normal  0.116194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.48 
 
 		 366 aa  146  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.122533  hitchhiker  0.00990126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2081  saccharopine dehydrogenase  37.84 
 
 		 371 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.484567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3768  hypothetical protein  42 
 
 		 480 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2673  Saccharopine dehydrogenase  30.92 
 
 		 377 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0130608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3964  Saccharopine dehydrogenase  27.49 
 
 		 360 aa  99.4  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0685  saccharopine dehydrogenase  29.21 
 
 		 356 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0753  saccharopine dehydrogenase  29.52 
 
 		 356 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54900  hypothetical protein  33.52 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000637066  unclonable  7.39539e-22 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41409  predicted protein  33.33 
 
 		 1506 aa  50.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.974379  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  22.32 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  23.03 
 
 		 367 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  28.19 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  32.79 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  25.83 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1148  saccharopine dehydrogenase  28.37 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0020  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  33.62 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  34.34 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.39 
 
 		 353 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4933  hypothetical protein  30.39 
 
 		 352 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0514  saccharopine dehydrogenase  32 
 
 		 377 aa  42.7  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  33.9 
 
 		 352 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3779  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase protein  39.47 
 
 		 353 aa  42.7  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>