22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3964 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3964  Saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 360 aa  739    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2673  Saccharopine dehydrogenase  29.21 
 
 		 377 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0130608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2819  saccharopine dehydrogenase  27.49 
 
 		 358 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 		 377 aa  86.7  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00494367  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2645  saccharopine dehydrogenase  27.78 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00207911  normal  0.116194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2081  saccharopine dehydrogenase  28.17 
 
 		 371 aa  82.8  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.484567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54900  hypothetical protein  24.72 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000637066  unclonable  7.39539e-22 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.122533  hitchhiker  0.00990126 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0685  saccharopine dehydrogenase  21.25 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1148  saccharopine dehydrogenase  30.34 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0753  saccharopine dehydrogenase  21.25 
 
 		 356 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  28.21 
 
 		 378 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  25.17 
 
 		 384 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  24.34 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1038  saccharopine dehydrogenase  29.66 
 
 		 325 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.264702 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  24.49 
 
 		 369 aa  50.4  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3768  hypothetical protein  26.92 
 
 		 480 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  26.14 
 
 		 376 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1135  Saccharopine dehydrogenase  30.25 
 
 		 368 aa  46.6  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  31.34 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5296  saccharopine dehydrogenase  27.66 
 
 		 351 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.813788  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  25.17 
 
 		 367 aa  43.5  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>