90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4677 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 401 aa  803    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  74.56 
 
 		 408 aa  605  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  74.75 
 
 		 407 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  74.75 
 
 		 407 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  74.5 
 
 		 407 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  71.08 
 
 		 407 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  68.41 
 
 		 403 aa  543  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  33.74 
 
 		 396 aa  192  9e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  32.25 
 
 		 396 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  31.93 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  31.82 
 
 		 398 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  32.67 
 
 		 398 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  31.44 
 
 		 405 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  30.56 
 
 		 399 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  34.1 
 
 		 395 aa  189  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  31.44 
 
 		 402 aa  186  7e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  31.06 
 
 		 398 aa  186  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  30.64 
 
 		 413 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  31.19 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  30.56 
 
 		 397 aa  180  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  29.8 
 
 		 398 aa  180  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  31.71 
 
 		 392 aa  180  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  30.94 
 
 		 401 aa  179  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  30.34 
 
 		 405 aa  179  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  31.42 
 
 		 399 aa  179  7e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  30.58 
 
 		 399 aa  179  9e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  31.68 
 
 		 401 aa  179  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  30.2 
 
 		 401 aa  179  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  31.23 
 
 		 396 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  29.46 
 
 		 404 aa  177  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  29.7 
 
 		 401 aa  178  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  29.7 
 
 		 401 aa  176  7e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  30.2 
 
 		 403 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  31.19 
 
 		 409 aa  175  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  29.3 
 
 		 413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  29.06 
 
 		 426 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  31.4 
 
 		 399 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  30.6 
 
 		 400 aa  173  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  28.78 
 
 		 397 aa  172  5.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  30.19 
 
 		 417 aa  173  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  29.46 
 
 		 401 aa  173  5.999999999999999e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  28.5 
 
 		 394 aa  172  9e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  29.32 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  29.85 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  29.06 
 
 		 413 aa  170  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  29.57 
 
 		 399 aa  171  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  30.81 
 
 		 398 aa  170  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  30.17 
 
 		 413 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  29.53 
 
 		 404 aa  168  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  28.99 
 
 		 414 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  30.17 
 
 		 403 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  30.1 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  30.1 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  28.74 
 
 		 414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  28.36 
 
 		 413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  30.38 
 
 		 398 aa  162  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  29.02 
 
 		 414 aa  162  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  30.08 
 
 		 405 aa  162  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0028  saccharopine dehydrogenase  28.54 
 
 		 412 aa  161  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  29.79 
 
 		 403 aa  159  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  30.86 
 
 		 399 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  27.61 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  30.86 
 
 		 399 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  30.1 
 
 		 412 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  28.05 
 
 		 412 aa  152  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  32.06 
 
 		 407 aa  150  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  30.58 
 
 		 412 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  30.58 
 
 		 412 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0914  putative saccharopine dehydrogenase family protein  27.66 
 
 		 424 aa  147  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.867111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1501  saccharopine dehydrogenase  27.68 
 
 		 424 aa  145  9e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1715  saccharopine dehydrogenase  27.54 
 
 		 422 aa  137  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000659439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  29.26 
 
 		 403 aa  110  6e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  26.6 
 
 		 398 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  23.82 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  25.45 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  24.25 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  20.97 
 
 		 394 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  24.82 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1441  hypothetical protein  20.97 
 
 		 394 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1342  hypothetical protein  21.36 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1217  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  21.36 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1241  hypothetical protein  21.36 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1416  hypothetical protein  21.36 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.572078 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1219  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  21.8 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.182404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  21.07 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1379  hypothetical protein  20.61 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  23.08 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3965  hypothetical protein  20.56 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1941  Saccharopine dehydrogenase  26.82 
 
 		 446 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2645  saccharopine dehydrogenase  31.39 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00207911  normal  0.116194 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>