92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1201 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  76.12 
 
 		 401 aa  635    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 402 aa  839    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  79.85 
 
 		 401 aa  673    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  65.49 
 
 		 396 aa  552  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  66.67 
 
 		 398 aa  552  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  65.74 
 
 		 409 aa  547  1e-154  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  66.92 
 
 		 396 aa  544  1e-154  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  66.41 
 
 		 396 aa  543  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  65.47 
 
 		 398 aa  541  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  65.41 
 
 		 399 aa  541  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  65.23 
 
 		 399 aa  534  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  64.71 
 
 		 398 aa  526  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  64.71 
 
 		 397 aa  525  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  64.19 
 
 		 398 aa  522  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  61.83 
 
 		 399 aa  521  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  61.32 
 
 		 403 aa  518  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  60.4 
 
 		 399 aa  513  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  59.25 
 
 		 405 aa  509  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  61.06 
 
 		 400 aa  509  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  59.39 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  60.61 
 
 		 403 aa  504  9.999999999999999e-143  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  63.64 
 
 		 403 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  59.45 
 
 		 400 aa  503  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  60.35 
 
 		 395 aa  501  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  59.29 
 
 		 401 aa  503  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  58.33 
 
 		 403 aa  499  1e-140  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  57.25 
 
 		 401 aa  498  1e-140  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  62.92 
 
 		 399 aa  498  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  59.7 
 
 		 405 aa  498  1e-140  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  59.7 
 
 		 392 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  57.25 
 
 		 401 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  57 
 
 		 401 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  57.76 
 
 		 405 aa  494  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  62.66 
 
 		 398 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  62.92 
 
 		 398 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  57 
 
 		 401 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  57.29 
 
 		 394 aa  489  1e-137  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  58.59 
 
 		 404 aa  491  1e-137  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  58.84 
 
 		 404 aa  483  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  57.93 
 
 		 399 aa  478  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  44.33 
 
 		 405 aa  360  3e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  43.32 
 
 		 414 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  43.46 
 
 		 417 aa  355  5e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  42.43 
 
 		 414 aa  345  1e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  42.57 
 
 		 414 aa  341  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  41.22 
 
 		 413 aa  328  7e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  41.65 
 
 		 413 aa  328  9e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  41.46 
 
 		 413 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  41.22 
 
 		 413 aa  324  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  40.24 
 
 		 413 aa  324  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  41.4 
 
 		 412 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  40.15 
 
 		 412 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  40.98 
 
 		 426 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  41.89 
 
 		 412 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  41.89 
 
 		 412 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  40.59 
 
 		 414 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  40.59 
 
 		 414 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1715  saccharopine dehydrogenase  41.52 
 
 		 422 aa  313  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000659439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0914  putative saccharopine dehydrogenase family protein  40.48 
 
 		 424 aa  311  1e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.867111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1501  saccharopine dehydrogenase  40.48 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0028  saccharopine dehydrogenase  39.4 
 
 		 412 aa  305  8.000000000000001e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  39.75 
 
 		 399 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  39.75 
 
 		 399 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  40.2 
 
 		 407 aa  290  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  34.88 
 
 		 407 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  34.88 
 
 		 407 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  34.88 
 
 		 407 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  33.17 
 
 		 408 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  33.17 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  31.36 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  32.38 
 
 		 401 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  23.77 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  25.19 
 
 		 415 aa  86.3  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1941  Saccharopine dehydrogenase  28.57 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  23.69 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  28.42 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  23.45 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  22.19 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  25.44 
 
 		 367 aa  51.6  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  22.74 
 
 		 394 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  25 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  21.08 
 
 		 378 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  30.72 
 
 		 454 aa  47  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  28.08 
 
 		 748 aa  47  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  21.46 
 
 		 369 aa  46.6  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  20 
 
 		 413 aa  46.6  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  25.43 
 
 		 392 aa  46.6  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3965  hypothetical protein  22.74 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  23.68 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4996  Saccharopine dehydrogenase  21.4 
 
 		 554 aa  43.5  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2221  saccharopine dehydrogenase  24.85 
 
 		 375 aa  43.1  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  21.58 
 
 		 384 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>