92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4440 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
401 aa  838    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  76.12 
 
 
402 aa  653    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  77.81 
 
 
401 aa  671    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  67.42 
 
 
396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  66.84 
 
 
398 aa  566  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  65.32 
 
 
398 aa  551  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  67.43 
 
 
396 aa  553  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  66.67 
 
 
396 aa  550  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  65.82 
 
 
399 aa  549  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  65.08 
 
 
399 aa  548  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  64.14 
 
 
409 aa  548  1e-155  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  64.56 
 
 
398 aa  544  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  64.56 
 
 
398 aa  544  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  64.36 
 
 
397 aa  536  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  60.79 
 
 
403 aa  531  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  61.15 
 
 
405 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  61.73 
 
 
401 aa  524  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  61.22 
 
 
399 aa  526  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  62.16 
 
 
400 aa  518  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  63.66 
 
 
403 aa  518  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  60.87 
 
 
399 aa  520  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  63.04 
 
 
399 aa  520  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  60.75 
 
 
397 aa  521  1e-146  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  62.53 
 
 
395 aa  520  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  61.31 
 
 
400 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  61.77 
 
 
403 aa  517  1.0000000000000001e-145  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  60 
 
 
401 aa  511  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  63.29 
 
 
404 aa  511  1e-144  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  62.78 
 
 
398 aa  512  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  59.4 
 
 
401 aa  513  1e-144  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  59.65 
 
 
401 aa  513  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  59.65 
 
 
401 aa  508  1e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  58.48 
 
 
403 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  62.53 
 
 
398 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  59.45 
 
 
394 aa  504  1e-141  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  59.85 
 
 
392 aa  502  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  60.71 
 
 
405 aa  498  1e-140  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  57.22 
 
 
404 aa  489  1e-137  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  57.97 
 
 
399 aa  488  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  58.78 
 
 
405 aa  481  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  46.29 
 
 
417 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  47.52 
 
 
405 aa  381  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  45.41 
 
 
414 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  45.02 
 
 
414 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  45.41 
 
 
414 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  41.56 
 
 
413 aa  335  7e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  41.08 
 
 
426 aa  332  9e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  42.34 
 
 
412 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  41.32 
 
 
413 aa  332  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  40.93 
 
 
413 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  40.83 
 
 
413 aa  327  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  41.32 
 
 
413 aa  327  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  40.69 
 
 
414 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  40.69 
 
 
414 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  42.09 
 
 
412 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  42.09 
 
 
412 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  39.61 
 
 
412 aa  317  3e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0028  saccharopine dehydrogenase  39.25 
 
 
412 aa  312  5.999999999999999e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0914  putative saccharopine dehydrogenase family protein  39.51 
 
 
424 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.867111  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  40.1 
 
 
399 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1715  saccharopine dehydrogenase  39.45 
 
 
422 aa  305  6e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000659439  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1501  saccharopine dehydrogenase  39.02 
 
 
424 aa  305  8.000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  39.85 
 
 
399 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  38.08 
 
 
407 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  33.66 
 
 
408 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  30.27 
 
 
407 aa  186  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  31.54 
 
 
407 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  31.54 
 
 
407 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  31.54 
 
 
407 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  30.71 
 
 
403 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  32.38 
 
 
401 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  24.87 
 
 
415 aa  93.2  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  23.12 
 
 
398 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  25.06 
 
 
385 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  23.03 
 
 
403 aa  66.6  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  25.96 
 
 
378 aa  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  23.25 
 
 
367 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  26.9 
 
 
350 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  23.66 
 
 
384 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  28.48 
 
 
376 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1941  Saccharopine dehydrogenase  24.05 
 
 
446 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  25.88 
 
 
367 aa  53.9  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  28.97 
 
 
748 aa  53.5  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  23.65 
 
 
369 aa  53.1  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  25.45 
 
 
454 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  25.44 
 
 
367 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 
295 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  20.47 
 
 
384 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  20.55 
 
 
413 aa  43.5  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  22.09 
 
 
392 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4536  saccharopine dehydrogenase  32.71 
 
 
557 aa  43.1  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.802227  normal  0.151907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4996  Saccharopine dehydrogenase  33.02 
 
 
554 aa  42.7  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.884276 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>