98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0748 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 400 aa  838    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  89.5 
 
 		 400 aa  765    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  66.5 
 
 		 399 aa  559  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  66.75 
 
 		 403 aa  557  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  66.58 
 
 		 396 aa  552  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  64.27 
 
 		 397 aa  546  1e-154  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  65.9 
 
 		 405 aa  546  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  65.56 
 
 		 395 aa  545  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  63.61 
 
 		 398 aa  545  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  65.98 
 
 		 405 aa  541  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  64.36 
 
 		 401 aa  543  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  64.81 
 
 		 396 aa  535  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  62.47 
 
 		 399 aa  524  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  64.3 
 
 		 396 aa  525  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  61.56 
 
 		 409 aa  527  1e-148  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  62.21 
 
 		 399 aa  527  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  62.25 
 
 		 403 aa  518  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  60.65 
 
 		 399 aa  515  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  62.63 
 
 		 392 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  61.06 
 
 		 398 aa  513  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  60.35 
 
 		 401 aa  509  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  61.86 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  61.56 
 
 		 399 aa  509  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  61.31 
 
 		 401 aa  506  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  59.8 
 
 		 398 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  59.45 
 
 		 402 aa  503  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  60.05 
 
 		 398 aa  499  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  59.85 
 
 		 399 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  60.35 
 
 		 398 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  55.89 
 
 		 401 aa  482  1e-135  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  59.55 
 
 		 398 aa  484  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  56.6 
 
 		 394 aa  480  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  56.71 
 
 		 404 aa  476  1e-133  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  57.89 
 
 		 404 aa  478  1e-133  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  56.46 
 
 		 403 aa  473  1e-132  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  55.78 
 
 		 403 aa  472  1e-132  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  54.25 
 
 		 401 aa  471  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  54 
 
 		 401 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  53.79 
 
 		 401 aa  464  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  54.77 
 
 		 405 aa  458  9.999999999999999e-129  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  48.02 
 
 		 417 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  47.03 
 
 		 414 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  45.27 
 
 		 414 aa  360  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  45.91 
 
 		 405 aa  359  5e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  45.05 
 
 		 414 aa  356  2.9999999999999997e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  42.54 
 
 		 412 aa  333  3e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  41.23 
 
 		 413 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  41.23 
 
 		 413 aa  327  3e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  41.4 
 
 		 412 aa  326  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0028  saccharopine dehydrogenase  41.29 
 
 		 412 aa  323  3e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  41.03 
 
 		 426 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  42.39 
 
 		 412 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  42.39 
 
 		 412 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  40.05 
 
 		 413 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  41.19 
 
 		 413 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  39.75 
 
 		 413 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  39.85 
 
 		 414 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  39.85 
 
 		 414 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1715  saccharopine dehydrogenase  38.96 
 
 		 422 aa  293  3e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000659439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0914  putative saccharopine dehydrogenase family protein  37.5 
 
 		 424 aa  290  4e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.867111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1501  saccharopine dehydrogenase  37.5 
 
 		 424 aa  289  7e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  39.9 
 
 		 407 aa  288  9e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  38.66 
 
 		 399 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  38.66 
 
 		 399 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  30.48 
 
 		 408 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  30.49 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  30.18 
 
 		 403 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  30.26 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  28.82 
 
 		 407 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  28.82 
 
 		 407 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  28.82 
 
 		 407 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  27.01 
 
 		 415 aa  106  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  24.25 
 
 		 398 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  26.5 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  25 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  24.68 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  25.64 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  30.27 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  21.28 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  23.1 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1941  Saccharopine dehydrogenase  24 
 
 		 446 aa  57  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  27.23 
 
 		 360 aa  53.1  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  20.4 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  23.33 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  24.65 
 
 		 748 aa  49.7  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  31.08 
 
 		 454 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1441  hypothetical protein  20.07 
 
 		 394 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  22.46 
 
 		 394 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  21.4 
 
 		 394 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  25.99 
 
 		 351 aa  46.6  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  25.31 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  28.21 
 
 		 345 aa  44.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4536  saccharopine dehydrogenase  23.39 
 
 		 557 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.802227  normal  0.151907 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  20.37 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1217  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  21.85 
 
 		 394 aa  43.5  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1342  hypothetical protein  21.85 
 
 		 394 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1241  hypothetical protein  21.85 
 
 		 394 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1416  hypothetical protein  21.85 
 
 		 394 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.572078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>