96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0125 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  78.14 
 
 		 396 aa  636    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  78.89 
 
 		 396 aa  641    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 403 aa  841    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  75.56 
 
 		 398 aa  652    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  72.68 
 
 		 396 aa  623  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  69.88 
 
 		 399 aa  590  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  70.6 
 
 		 398 aa  577  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  68.34 
 
 		 398 aa  568  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  69.35 
 
 		 397 aa  570  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  67.84 
 
 		 399 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  68.84 
 
 		 398 aa  560  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  64.27 
 
 		 401 aa  551  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  64.39 
 
 		 401 aa  551  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  68.84 
 
 		 399 aa  553  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  68.34 
 
 		 398 aa  547  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  69.35 
 
 		 398 aa  545  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  62.75 
 
 		 409 aa  543  1e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  65.66 
 
 		 395 aa  538  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  62.03 
 
 		 399 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  63.16 
 
 		 403 aa  535  1e-151  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  63.38 
 
 		 399 aa  537  1e-151  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  62.25 
 
 		 400 aa  535  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  63.64 
 
 		 402 aa  528  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  63.25 
 
 		 405 aa  527  1e-148  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  61.11 
 
 		 397 aa  526  1e-148  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  59.5 
 
 		 401 aa  523  1e-147  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  61.81 
 
 		 400 aa  524  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  63.66 
 
 		 401 aa  524  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  61.71 
 
 		 405 aa  520  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  62.88 
 
 		 405 aa  519  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  59.5 
 
 		 401 aa  519  1e-146  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  59.25 
 
 		 401 aa  515  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  64.21 
 
 		 392 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  61.46 
 
 		 403 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  59.25 
 
 		 401 aa  517  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  59.15 
 
 		 403 aa  507  9.999999999999999e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  61.42 
 
 		 399 aa  501  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  60.65 
 
 		 404 aa  503  1e-141  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  59.65 
 
 		 404 aa  500  1e-140  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  58.23 
 
 		 394 aa  491  1e-137  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  45.77 
 
 		 414 aa  360  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  45.52 
 
 		 417 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  44.23 
 
 		 414 aa  354  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  44.67 
 
 		 405 aa  347  2e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  43.41 
 
 		 414 aa  347  2e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  42.89 
 
 		 412 aa  329  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  42.4 
 
 		 413 aa  329  7e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  42.65 
 
 		 413 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  42.4 
 
 		 412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  43.38 
 
 		 412 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  43.38 
 
 		 412 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  42.4 
 
 		 413 aa  322  5e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  42.4 
 
 		 413 aa  322  7e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  40.44 
 
 		 414 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  40.44 
 
 		 414 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  40.69 
 
 		 413 aa  317  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  41.42 
 
 		 426 aa  316  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0028  saccharopine dehydrogenase  40.85 
 
 		 412 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  40.49 
 
 		 407 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  39.39 
 
 		 399 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  39.14 
 
 		 399 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0914  putative saccharopine dehydrogenase family protein  40 
 
 		 424 aa  293  4e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.867111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1501  saccharopine dehydrogenase  39.85 
 
 		 424 aa  291  1e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1715  saccharopine dehydrogenase  39.12 
 
 		 422 aa  287  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000659439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  32.28 
 
 		 408 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  32.98 
 
 		 403 aa  186  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  31.63 
 
 		 407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  31.64 
 
 		 407 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  31.64 
 
 		 407 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  31.64 
 
 		 407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  31.01 
 
 		 401 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  25 
 
 		 398 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  25.32 
 
 		 415 aa  90.1  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  23.38 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  22.37 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  22.11 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  24.47 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1219  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  22.38 
 
 		 394 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.182404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  22.22 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  21.81 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  21.86 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1342  hypothetical protein  22.02 
 
 		 394 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1241  hypothetical protein  22.02 
 
 		 394 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1217  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  22.02 
 
 		 394 aa  57  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1416  hypothetical protein  22.02 
 
 		 394 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.572078 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1941  Saccharopine dehydrogenase  21.46 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  27.94 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  25.09 
 
 		 350 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  21.14 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1441  hypothetical protein  21.15 
 
 		 394 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  27.03 
 
 		 371 aa  50.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3965  hypothetical protein  21.19 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1138  putative transmembrane protein  28.57 
 
 		 375 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1379  hypothetical protein  20.15 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  22.73 
 
 		 748 aa  43.9  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  27.33 
 
 		 360 aa  43.9  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>