90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4946 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 407 aa  829    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 407 aa  829    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  99.75 
 
 		 407 aa  827    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  77.24 
 
 		 407 aa  613  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  71.78 
 
 		 408 aa  584  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  74.8 
 
 		 401 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  69.14 
 
 		 403 aa  548  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  34.88 
 
 		 402 aa  207  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  30.68 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  30.07 
 
 		 396 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  30.5 
 
 		 398 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  32.03 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  29.95 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  32.2 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  30.92 
 
 		 398 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  28.99 
 
 		 401 aa  184  3e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  31.19 
 
 		 398 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  29.13 
 
 		 401 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  30.66 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  28.78 
 
 		 399 aa  180  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  29.75 
 
 		 397 aa  180  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  28.74 
 
 		 401 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  30.84 
 
 		 401 aa  180  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  29.25 
 
 		 398 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  30.71 
 
 		 397 aa  177  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  28.99 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  30.41 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  29.78 
 
 		 399 aa  176  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  30.47 
 
 		 399 aa  176  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  30.07 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  28.26 
 
 		 404 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  30.47 
 
 		 392 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  28.64 
 
 		 401 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  30.03 
 
 		 399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  29.43 
 
 		 414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  28.99 
 
 		 401 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  30.3 
 
 		 400 aa  173  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  31.14 
 
 		 401 aa  173  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  28.75 
 
 		 394 aa  173  5e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  29.76 
 
 		 398 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  29.33 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  31.12 
 
 		 395 aa  170  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  30.73 
 
 		 403 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  28.23 
 
 		 414 aa  167  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  28.23 
 
 		 414 aa  162  7e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  28.78 
 
 		 399 aa  162  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  30.71 
 
 		 412 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  28.8 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  28.82 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  27.29 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  27.12 
 
 		 413 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  28.64 
 
 		 403 aa  156  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  28.78 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  26.88 
 
 		 413 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  27.29 
 
 		 405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  26.39 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  27.99 
 
 		 413 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  26.88 
 
 		 413 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  27.99 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  27.99 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  29.85 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  27.4 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  29.9 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  29.9 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  28.21 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  28.21 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  26.37 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0914  putative saccharopine dehydrogenase family protein  26.75 
 
 		 424 aa  135  9e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.867111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1501  saccharopine dehydrogenase  26.27 
 
 		 424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1715  saccharopine dehydrogenase  25.66 
 
 		 422 aa  127  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000659439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0028  saccharopine dehydrogenase  23.97 
 
 		 412 aa  125  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  29.58 
 
 		 403 aa  106  7e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  25 
 
 		 398 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  24.87 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  24.77 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  22.9 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  24.41 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1941  Saccharopine dehydrogenase  26.25 
 
 		 446 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1379  hypothetical protein  22.91 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1441  hypothetical protein  21.55 
 
 		 394 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  21.53 
 
 		 394 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  22.17 
 
 		 394 aa  53.1  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3965  hypothetical protein  22.58 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1219  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  21.74 
 
 		 394 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.182404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1416  hypothetical protein  21.4 
 
 		 394 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.572078 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1342  hypothetical protein  21.4 
 
 		 394 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1217  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  21.4 
 
 		 394 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1241  hypothetical protein  21.4 
 
 		 394 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  22.33 
 
 		 392 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  26.69 
 
 		 454 aa  43.1  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>