58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2810 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2810  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 380 aa  751    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111095  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  56.46 
 
 		 373 aa  428  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  55.34 
 
 		 367 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  54.44 
 
 		 367 aa  411  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  54.44 
 
 		 367 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  52.26 
 
 		 365 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  53.67 
 
 		 373 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  56.83 
 
 		 385 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  52.32 
 
 		 392 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  52.26 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  52.54 
 
 		 365 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3947  Saccharopine dehydrogenase  54.82 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  51.41 
 
 		 366 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  51.41 
 
 		 366 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  51.41 
 
 		 366 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  51.41 
 
 		 366 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  50.85 
 
 		 366 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  53.39 
 
 		 389 aa  362  6e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1645  saccharopine dehydrogenase  50.85 
 
 		 366 aa  359  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1645  saccharopine dehydrogenase  50.85 
 
 		 366 aa  359  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.733408 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  50.85 
 
 		 366 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  50.85 
 
 		 366 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1737  saccharopine dehydrogenase  50.85 
 
 		 366 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1536  saccharopine dehydrogenase  50.85 
 
 		 366 aa  358  8e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5016  saccharopine dehydrogenase  50.56 
 
 		 366 aa  358  9e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.288707  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  53.39 
 
 		 389 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2155  saccharopine dehydrogenase  51.67 
 
 		 367 aa  348  7e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  50.41 
 
 		 393 aa  342  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  44.88 
 
 		 362 aa  324  1e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  44.88 
 
 		 362 aa  324  1e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  46.29 
 
 		 376 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  49.05 
 
 		 397 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0566  saccharopine dehydrogenase  46.11 
 
 		 385 aa  309  5e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.411174 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5587  Saccharopine dehydrogenase  44.44 
 
 		 376 aa  309  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  43.82 
 
 		 379 aa  309  6.999999999999999e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  37.36 
 
 		 354 aa  266  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  40.06 
 
 		 354 aa  263  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  39.6 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  39.03 
 
 		 360 aa  249  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  29.19 
 
 		 392 aa  142  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  32.46 
 
 		 413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  29.92 
 
 		 384 aa  126  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  28.37 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  29.01 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  29 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  28.36 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  26.99 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  26.19 
 
 		 369 aa  97.8  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  24 
 
 		 444 aa  53.1  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  26.67 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  22.76 
 
 		 748 aa  50.8  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  23.92 
 
 		 398 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0572  saccharopine dehydrogenase  25 
 
 		 388 aa  47  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1148  saccharopine dehydrogenase  29.21 
 
 		 325 aa  46.6  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  22.09 
 
 		 934 aa  46.2  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  26.83 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0007  saccharopine dehydrogenase  28.31 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  19.85 
 
 		 450 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>