More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0106 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 284 aa  578  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  71.07 
 
 		 286 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  70.59 
 
 		 274 aa  391  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  69.52 
 
 		 272 aa  380  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  65.19 
 
 		 270 aa  355  2.9999999999999997e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  65.04 
 
 		 272 aa  337  9e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.98 
 
 		 271 aa  289  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  56.23 
 
 		 272 aa  285  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  55.98 
 
 		 271 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.21 
 
 		 273 aa  277  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.45 
 
 		 273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.73 
 
 		 246 aa  268  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.664099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  54.81 
 
 		 270 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.88 
 
 		 275 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  54.17 
 
 		 270 aa  265  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  46.99 
 
 		 268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  46.07 
 
 		 268 aa  228  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0942  short chain dehydrogenase  45.49 
 
 		 268 aa  227  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  43.18 
 
 		 268 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3447  short chain dehydrogenase  45.67 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.15 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5364  short chain dehydrogenase  45.38 
 
 		 270 aa  208  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6137  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 		 268 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  0.683407 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3322  short chain dehydrogenase  43.53 
 
 		 268 aa  208  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0896668  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6530  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 		 268 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.744865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1300  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  43.28 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  40.66 
 
 		 304 aa  178  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4067  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  37.31 
 
 		 298 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122191  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 		 273 aa  176  6e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  39.93 
 
 		 278 aa  172  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 		 314 aa  172  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  40.47 
 
 		 278 aa  172  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 		 267 aa  172  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  39.03 
 
 		 273 aa  172  7.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 		 283 aa  169  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 		 268 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 		 268 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.3 
 
 		 268 aa  165  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  39.62 
 
 		 287 aa  165  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  40.46 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  39 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 286 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 266 aa  159  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 280 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  39.69 
 
 		 277 aa  158  8e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.29 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0718028  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.9 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 280 aa  155  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.61 
 
 		 271 aa  155  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  33.08 
 
 		 272 aa  155  7e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  37 
 
 		 344 aa  155  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 		 307 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  38.26 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 		 279 aa  152  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 		 271 aa  152  7e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.09 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.09 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 		 281 aa  149  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  38.52 
 
 		 276 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 		 338 aa  149  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  34.3 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  35.69 
 
 		 275 aa  149  5e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  35.02 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  35.02 
 
 		 281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  35.02 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  34.66 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  33.21 
 
 		 291 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  35.14 
 
 		 283 aa  146  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  33.94 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  33.94 
 
 		 291 aa  145  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 		 317 aa  145  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  33.94 
 
 		 291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.18 
 
 		 275 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158642  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  36.43 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  32.75 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3194  short chain dehydrogenase  33.96 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234456  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  38.37 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  36.18 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  36.89 
 
 		 282 aa  142  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  32.96 
 
 		 272 aa  143  4e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  34.78 
 
 		 283 aa  142  5e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.09 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  37.01 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 272 aa  142  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.79 
 
 		 306 aa  142  8e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 		 268 aa  142  9e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3022  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.515629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>