More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6615 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 271 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  64.81 
 
 		 272 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.15 
 
 		 273 aa  322  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.41 
 
 		 273 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.52 
 
 		 271 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.94 
 
 		 275 aa  315  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  59.26 
 
 		 270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  56.76 
 
 		 272 aa  299  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.41 
 
 		 246 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.664099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  56.46 
 
 		 270 aa  292  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  54.51 
 
 		 286 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  53.67 
 
 		 270 aa  278  5e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  55.21 
 
 		 284 aa  269  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  50.94 
 
 		 274 aa  262  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  49.43 
 
 		 272 aa  248  9e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  45.95 
 
 		 268 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  46.54 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  46.72 
 
 		 268 aa  223  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5364  short chain dehydrogenase  46.67 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0942  short chain dehydrogenase  44.4 
 
 		 268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3447  short chain dehydrogenase  45.67 
 
 		 268 aa  211  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3322  short chain dehydrogenase  45.78 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0896668  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6137  short chain dehydrogenase  46.46 
 
 		 268 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  0.683407 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6530  short chain dehydrogenase  46.46 
 
 		 268 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.744865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1300  short chain dehydrogenase  46.06 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.59 
 
 		 269 aa  195  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.35 
 
 		 314 aa  186  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4067  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  38.13 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122191  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  39.11 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  39.48 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  39.19 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  37.68 
 
 		 273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  39.93 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0718028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  39.85 
 
 		 277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 		 291 aa  172  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  38.95 
 
 		 283 aa  171  7.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  40.53 
 
 		 275 aa  169  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 		 268 aa  169  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  38.95 
 
 		 279 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  36 
 
 		 304 aa  166  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 300 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 		 279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  37.68 
 
 		 344 aa  165  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  34.21 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.18 
 
 		 317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 		 280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.05 
 
 		 306 aa  162  6e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 		 286 aa  161  9e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 		 267 aa  159  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  33.21 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3557  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 		 277 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18665  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.09 
 
 		 307 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  41.04 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4006  short chain dehydrogenase  37.04 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  38.35 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.29 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3850  short chain dehydrogenase  36.94 
 
 		 277 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.77 
 
 		 271 aa  152  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 		 286 aa  152  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6770  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 		 276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 279 aa  152  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.46 
 
 		 273 aa  150  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1140  short-chain dehydrogenase/reductase  37.87 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.34 
 
 		 275 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158642  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0065  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  36.75 
 
 		 274 aa  149  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 		 276 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 		 284 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 276 aa  149  4e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  39.83 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 286 aa  149  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.42 
 
 		 272 aa  148  8e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 		 272 aa  148  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3194  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 		 256 aa  148  9e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234456  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3029  short chain dehydrogenase  37.21 
 
 		 277 aa  148  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.430063  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  39.61 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.34 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>