More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2206 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 276 aa  564  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  82.91 
 
 		 276 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.68 
 
 		 277 aa  349  4e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.82 
 
 		 285 aa  345  5e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 		 283 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.3 
 
 		 274 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.21 
 
 		 283 aa  321  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.04 
 
 		 279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1152  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.04 
 
 		 258 aa  291  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.1 
 
 		 281 aa  290  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.91 
 
 		 282 aa  280  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.64 
 
 		 279 aa  265  8e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.87 
 
 		 280 aa  258  7e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.59 
 
 		 296 aa  251  8.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.73 
 
 		 279 aa  243  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.35 
 
 		 299 aa  241  7.999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 		 281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 		 280 aa  231  8.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.76 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.22 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.64 
 
 		 280 aa  230  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.03 
 
 		 280 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 		 276 aa  227  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.96 
 
 		 279 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.15 
 
 		 282 aa  223  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  42.49 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.04 
 
 		 283 aa  221  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.93 
 
 		 276 aa  221  8e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.68 
 
 		 290 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.64 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.07 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.81 
 
 		 275 aa  218  7e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.16 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.97 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  43.43 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 		 284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.18 
 
 		 276 aa  215  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.07 
 
 		 284 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.88 
 
 		 277 aa  214  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  43.64 
 
 		 280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.239273 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 		 283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  43.84 
 
 		 278 aa  212  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  41.91 
 
 		 280 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.03 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.55 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 292 aa  209  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 		 280 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.04 
 
 		 276 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.18 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0984  short chain dehydrogenase  43.01 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 		 279 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.65 
 
 		 282 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  43.07 
 
 		 274 aa  203  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  39.71 
 
 		 284 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  41.76 
 
 		 279 aa  202  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 		 291 aa  201  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.64 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.36 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.79 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 275 aa  200  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 		 285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00800542  normal  0.26199 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  39.34 
 
 		 284 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 279 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.21 
 
 		 280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3499  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.7 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.65 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0160935 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  41.73 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  40.66 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  42.44 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2359  short chain dehydrogenase  39.78 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  41.33 
 
 		 284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  41.09 
 
 		 276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  41.7 
 
 		 277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8863  short chain dehydrogenase  40.15 
 
 		 282 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 		 295 aa  196  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 282 aa  195  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.03 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.54 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.05 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7039  short chain dehydrogenase  38.24 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0246661  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  40.44 
 
 		 274 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  40.44 
 
 		 274 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  40.44 
 
 		 274 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.28 
 
 		 283 aa  191  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6478  short chain dehydrogenase  40.59 
 
 		 277 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0193628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3237  short chain dehydrogenase  40.51 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.996911 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  37.87 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  40.81 
 
 		 285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.48 
 
 		 272 aa  189  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  41.82 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  38.97 
 
 		 276 aa  188  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.01 
 
 		 274 aa  188  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  38.32 
 
 		 282 aa  188  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  42.65 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  37.01 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>