More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0037 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  100 
 
 
283 aa  569  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  62.14 
 
 
282 aa  365  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.78 
 
 
273 aa  317  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135056  normal  0.0706675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  56.63 
 
 
285 aa  297  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.24 
 
 
274 aa  288  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  54.91 
 
 
274 aa  288  6e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  54.91 
 
 
274 aa  288  6e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  54.91 
 
 
274 aa  288  6e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.92 
 
 
275 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.45 
 
 
273 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.22 
 
 
272 aa  275  5e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  53.85 
 
 
274 aa  273  3e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.45 
 
 
272 aa  270  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.14 
 
 
272 aa  269  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  45.59 
 
 
287 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.21 
 
 
268 aa  240  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  46.86 
 
 
303 aa  227  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  46.39 
 
 
280 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
292 aa  223  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6368  short chain dehydrogenase  46.86 
 
 
279 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  44.87 
 
 
280 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.73 
 
 
295 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 
278 aa  209  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 
281 aa  208  9e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  44.24 
 
 
279 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.64 
 
 
282 aa  206  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  40.88 
 
 
286 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.42 
 
 
288 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2331  short chain dehydrogenase  49.63 
 
 
285 aa  202  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
282 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.88 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.61 
 
 
290 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
286 aa  198  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.84 
 
 
279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
277 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  39.26 
 
 
284 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
282 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.07 
 
 
289 aa  193  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
285 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.52 
 
 
284 aa  192  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0885  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.42 
 
 
305 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 
293 aa  192  8e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.37 
 
 
287 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.35 
 
 
275 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.29 
 
 
279 aa  191  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.42 
 
 
283 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.62 
 
 
280 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 
286 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.6 
 
 
279 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
282 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3237  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 
274 aa  189  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.996911 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
280 aa  188  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
282 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.65 
 
 
276 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  38.52 
 
 
284 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1825  short chain dehydrogenase  39.71 
 
 
278 aa  186  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356255  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.84 
 
 
281 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.966352 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0757  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  37.64 
 
 
282 aa  186  4e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0227485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
282 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6770  short chain dehydrogenase  40.07 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
280 aa  183  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.16 
 
 
283 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  41.94 
 
 
280 aa  183  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.26 
 
 
276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 
291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 
291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 
291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 
279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 
276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.406068  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 
293 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  38.38 
 
 
276 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
291 aa  182  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 
284 aa  182  8.000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  40.08 
 
 
847 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
279 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
279 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.6 
 
 
284 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
293 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.3 
 
 
274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
279 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
290 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.92 
 
 
283 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366194  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.55 
 
 
291 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
275 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
277 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.54 
 
 
279 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96036  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0984  short chain dehydrogenase  39.1 
 
 
283 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  37.78 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 
280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  37.14 
 
 
277 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1744  short chain dehydrogenase  41.22 
 
 
275 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324234  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>