More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0971 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  100 
 
 
287 aa  594  1e-169  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  54.77 
 
 
284 aa  313  1.9999999999999998e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0757  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  51.77 
 
 
282 aa  292  4e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0227485  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  46.81 
 
 
286 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 
282 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.76 
 
 
287 aa  249  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  43.57 
 
 
284 aa  244  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  43.21 
 
 
284 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  44.6 
 
 
280 aa  241  7e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
280 aa  238  6.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  44.57 
 
 
276 aa  235  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.65 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  43.59 
 
 
280 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  43.75 
 
 
284 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  43.59 
 
 
280 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.64 
 
 
279 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  43.48 
 
 
276 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.32 
 
 
280 aa  230  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  42.96 
 
 
278 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 
284 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 
279 aa  221  9e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
279 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  40.88 
 
 
277 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  40.88 
 
 
277 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  40.88 
 
 
277 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.75 
 
 
284 aa  219  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  40 
 
 
276 aa  219  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  41.24 
 
 
277 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6478  short chain dehydrogenase  40.51 
 
 
277 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0193628  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.79 
 
 
281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.12 
 
 
276 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  41.09 
 
 
277 aa  211  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.16 
 
 
293 aa  210  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
276 aa  210  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
276 aa  209  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 
279 aa  209  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
292 aa  208  9e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  39.93 
 
 
280 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  40 
 
 
277 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
285 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7039  short chain dehydrogenase  37.72 
 
 
275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0246661  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.07 
 
 
283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  37.37 
 
 
275 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2359  short chain dehydrogenase  38.06 
 
 
277 aa  198  9e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.97 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.83 
 
 
279 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  41.48 
 
 
274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.07 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  41.48 
 
 
274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  41.48 
 
 
274 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8863  short chain dehydrogenase  40.14 
 
 
282 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
280 aa  196  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
274 aa  195  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 
286 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  37.83 
 
 
282 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
277 aa  193  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 
276 aa  192  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.99 
 
 
278 aa  192  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
296 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
281 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  39.33 
 
 
285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.57 
 
 
283 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 
277 aa  189  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
285 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
275 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.07 
 
 
283 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
282 aa  188  9e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
279 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
279 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  40.37 
 
 
274 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.68 
 
 
299 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
273 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0984  short chain dehydrogenase  38.79 
 
 
283 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.09 
 
 
274 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
276 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.3 
 
 
280 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.68 
 
 
281 aa  186  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.966352 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.32 
 
 
286 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  41.13 
 
 
303 aa  185  6e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96036  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.55 
 
 
268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
286 aa  183  3e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.77 
 
 
279 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.77 
 
 
282 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  37.78 
 
 
283 aa  182  7e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
295 aa  181  9.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  39.26 
 
 
847 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
276 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
273 aa  179  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135056  normal  0.0706675 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  35.27 
 
 
278 aa  179  4.999999999999999e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  36.19 
 
 
287 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.64 
 
 
290 aa  178  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 
282 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.07 
 
 
279 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
279 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
272 aa  176  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
275 aa  175  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
293 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.13 
 
 
293 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>