More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1073 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  100 
 
 
847 aa  1699    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  85.71 
 
 
847 aa  1463    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1089  thiamine pyrophosphate protein central region  41.99 
 
 
550 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1326  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.23 
 
 
557 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4120  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.57 
 
 
568 aa  330  6e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0296  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.3 
 
 
568 aa  313  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414678  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4360  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  32.23 
 
 
640 aa  294  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5210  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.73 
 
 
549 aa  294  5e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11850  hypothetical protein  33.88 
 
 
547 aa  290  6e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0112  thiamine pyrophosphate domain protein TPP-binding  32.17 
 
 
582 aa  279  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246122  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2332  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.48 
 
 
588 aa  276  9e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.428788  normal  0.0160517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2293  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  36.3 
 
 
570 aa  274  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2340  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.3 
 
 
570 aa  274  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.425304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3099  thiamine pyrophosphate domain protein TPP-binding  34.25 
 
 
579 aa  260  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1100  hypothetical protein  33.52 
 
 
540 aa  260  8e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.575745  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2028  putative acetolactate synthase (acetohydroxy-acid synthase) (ALS), TPP-requiring enzyme  34.4 
 
 
570 aa  254  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1207  hypothetical protein  34.32 
 
 
540 aa  251  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2914  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  33.39 
 
 
548 aa  247  6e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.540468  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7728  hypothetical protein  34.09 
 
 
559 aa  243  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8313  putative acetolactate synthase  32.85 
 
 
550 aa  243  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.387847 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0486  putative oxalyl-CoA decarboxylase  31.24 
 
 
584 aa  239  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10119  putative oxalyl-CoA decarboxylase  33.15 
 
 
582 aa  232  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10214  2-hydroxyphytanoyl-CoA lyase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05230)  28.06 
 
 
605 aa  231  5e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00157482  normal  0.477766 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  28.75 
 
 
578 aa  231  5e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0544  acetolactate synthase-like TPP-requiring enzyme  32.16 
 
 
586 aa  231  5e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0553  hypothetical protein  31.77 
 
 
553 aa  229  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000755623  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  29.17 
 
 
576 aa  230  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5585  putative oxalyl-CoA decarboxylase  29.48 
 
 
581 aa  230  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  29.22 
 
 
552 aa  229  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3114  putative oxalyl-CoA decarboxylase  29.8 
 
 
576 aa  228  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.857507  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0189  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  29.38 
 
 
578 aa  228  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000920393  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.47 
 
 
588 aa  226  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2759  putative oxalyl-CoA decarboxylase  30.73 
 
 
580 aa  226  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  29.59 
 
 
566 aa  225  3e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2502  putative oxalyl-CoA decarboxylase  31.17 
 
 
581 aa  224  7e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4838  putative oxalyl-CoA decarboxylase  29.87 
 
 
598 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4487  putative oxalyl-CoA decarboxylase  30.6 
 
 
609 aa  220  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  29.35 
 
 
551 aa  219  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2800  putative oxalyl-CoA decarboxylase  31.05 
 
 
576 aa  219  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193882  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1369  putative oxalyl-CoA decarboxylase  29.14 
 
 
583 aa  219  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1209  putative oxalyl-CoA decarboxylase  29.14 
 
 
583 aa  219  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.32462 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6740  putative oxalyl-CoA decarboxylase  30.43 
 
 
580 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.766112 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0637  putative oxalyl-CoA decarboxylase  29.55 
 
 
569 aa  217  5.9999999999999996e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4056  putative oxalyl-CoA decarboxylase  31.12 
 
 
601 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.275504  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3618  putative oxalyl-CoA decarboxylase  30.22 
 
 
579 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000526627  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1710  hypothetical protein  32.42 
 
 
551 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4356  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  32.04 
 
 
597 aa  214  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0195043  normal  0.165363 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.14 
 
 
569 aa  214  7e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2523  putative oxalyl-CoA decarboxylase  29.36 
 
 
564 aa  213  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2769  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.58 
 
 
604 aa  213  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1149  putative oxalyl-CoA decarboxylase  29.2 
 
 
584 aa  213  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.314848  normal  0.637283 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1114  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.99 
 
 
562 aa  213  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  32.16 
 
 
620 aa  213  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.9 
 
 
552 aa  212  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0905  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.94 
 
 
615 aa  211  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0892  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.75 
 
 
581 aa  211  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.806334  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0745  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.75 
 
 
581 aa  211  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.425404  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  31.46 
 
 
549 aa  210  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04345  conserved hypothetical protein  28.45 
 
 
606 aa  209  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.29 
 
 
574 aa  209  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.44 
 
 
582 aa  209  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4664  putative oxalyl-CoA decarboxylase  27.9 
 
 
577 aa  208  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2661  putative oxalyl-CoA decarboxylase  29.36 
 
 
564 aa  208  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  29.88 
 
 
578 aa  208  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1296  putative oxalyl-CoA decarboxylase  29.17 
 
 
564 aa  208  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0954  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.64 
 
 
573 aa  207  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2742  putative oxalyl-CoA decarboxylase  29.36 
 
 
564 aa  207  8e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0494  putative oxalyl-CoA decarboxylase  29.84 
 
 
576 aa  207  8e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000405368  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02283  hypothetical protein  29.17 
 
 
564 aa  206  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1284  oxalyl-CoA decarboxylase  29.17 
 
 
564 aa  206  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.37 
 
 
573 aa  206  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.96 
 
 
554 aa  206  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2510  putative oxalyl-CoA decarboxylase  29.17 
 
 
564 aa  206  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.397201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4634  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  28.4 
 
 
581 aa  206  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0123329  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02244  hypothetical protein  29.17 
 
 
564 aa  206  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.31 
 
 
535 aa  206  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3605  putative oxalyl-CoA decarboxylase  29.17 
 
 
564 aa  206  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.376687 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.24 
 
 
561 aa  206  2e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.35 
 
 
581 aa  205  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.21 
 
 
562 aa  205  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1902  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.95 
 
 
566 aa  205  3e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000354639  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.72 
 
 
562 aa  204  7e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2270  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.83 
 
 
576 aa  203  8e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  29.37 
 
 
562 aa  204  8e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.42 
 
 
563 aa  203  9e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.18 
 
 
581 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  27.48 
 
 
587 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  28.34 
 
 
587 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.29 
 
 
552 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  28.45 
 
 
577 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2037  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.27 
 
 
564 aa  202  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182642  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4516  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  29.06 
 
 
605 aa  202  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0634  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.88 
 
 
573 aa  202  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3773  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  29.2 
 
 
616 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.58 
 
 
573 aa  201  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0639  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.02 
 
 
593 aa  201  5e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0915985  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0620  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.59 
 
 
560 aa  201  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.635865  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.21 
 
 
572 aa  201  6e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  27.99 
 
 
587 aa  201  7e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0220  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  28.13 
 
 
580 aa  200  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>