More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8648 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 282 aa  557  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  95.65 
 
 		 279 aa  504  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56 
 
 		 296 aa  286  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.12 
 
 		 290 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 291 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.57 
 
 		 289 aa  259  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.18 
 
 		 276 aa  254  8e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.55 
 
 		 282 aa  252  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.91 
 
 		 282 aa  251  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.93 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.93 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.93 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.82 
 
 		 293 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.38 
 
 		 291 aa  248  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.1 
 
 		 293 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.99 
 
 		 292 aa  241  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.08 
 
 		 293 aa  237  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.76 
 
 		 280 aa  236  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  49.27 
 
 		 280 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  48.91 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  47.99 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.57 
 
 		 277 aa  229  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.81 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.65 
 
 		 279 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  44.93 
 
 		 274 aa  225  6e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  45.52 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  46.97 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  46.97 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  46.97 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.73 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.93 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 		 278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.406068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 		 281 aa  216  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.64 
 
 		 276 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  44.7 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.93 
 
 		 274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.76 
 
 		 279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  43.22 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  44.16 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.65 
 
 		 276 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.08 
 
 		 279 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.25 
 
 		 274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 		 290 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 		 290 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.33 
 
 		 287 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.84 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  43.07 
 
 		 303 aa  209  6e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.2 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.69 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.23 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.22 
 
 		 272 aa  206  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 		 273 aa  205  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48 
 
 		 281 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.49 
 
 		 279 aa  204  9e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.76 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.49 
 
 		 286 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  42.34 
 
 		 279 aa  201  8e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  41.88 
 
 		 280 aa  201  9e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  41.3 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 		 286 aa  198  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 		 286 aa  198  7e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 		 280 aa  198  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.18 
 
 		 275 aa  198  9e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.81 
 
 		 275 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.05 
 
 		 279 aa  198  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.1 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.56 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6368  short chain dehydrogenase  45.99 
 
 		 279 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.18 
 
 		 276 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  43.91 
 
 		 283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.18 
 
 		 272 aa  196  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  42.18 
 
 		 277 aa  195  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  41.39 
 
 		 277 aa  195  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  47.54 
 
 		 284 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  40.91 
 
 		 287 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0984  short chain dehydrogenase  41.45 
 
 		 283 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  40.81 
 
 		 277 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.68 
 
 		 278 aa  192  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0773345 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.86 
 
 		 285 aa  191  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  40.44 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  40.74 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  40.74 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  40.37 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.75 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.86 
 
 		 281 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  43.09 
 
 		 279 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  39.86 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.33 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.65 
 
 		 284 aa  189  5.999999999999999e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6478  short chain dehydrogenase  40.44 
 
 		 277 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0193628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  40.36 
 
 		 276 aa  188  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>