More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6478 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6478  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 277 aa  556  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0193628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  96.75 
 
 		 277 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  89.89 
 
 		 277 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  89.89 
 
 		 277 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  89.89 
 
 		 277 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  87.36 
 
 		 276 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  75.09 
 
 		 277 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  73.65 
 
 		 277 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  72.2 
 
 		 279 aa  412  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2359  short chain dehydrogenase  68.59 
 
 		 277 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  71.69 
 
 		 276 aa  394  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  70.96 
 
 		 276 aa  391  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  63.27 
 
 		 275 aa  350  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7039  short chain dehydrogenase  63.04 
 
 		 275 aa  348  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0246661  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0984  short chain dehydrogenase  60.74 
 
 		 283 aa  332  5e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  61.71 
 
 		 280 aa  325  7e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8863  short chain dehydrogenase  61.71 
 
 		 282 aa  322  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2238  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.16 
 
 		 175 aa  246  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 281 aa  246  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.7 
 
 		 276 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  46.13 
 
 		 280 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  46.84 
 
 		 278 aa  232  7.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.74 
 
 		 279 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.1 
 
 		 280 aa  230  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.86 
 
 		 284 aa  229  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  45.39 
 
 		 280 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.88 
 
 		 287 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.21 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.94 
 
 		 273 aa  226  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  49.26 
 
 		 284 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.49 
 
 		 284 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.29 
 
 		 279 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  43.91 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.27 
 
 		 276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.6 
 
 		 285 aa  212  5.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.96 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  42.8 
 
 		 284 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  40.51 
 
 		 287 aa  208  7e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  42.07 
 
 		 284 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 		 281 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.52 
 
 		 276 aa  204  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.76 
 
 		 279 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  44.09 
 
 		 284 aa  202  4e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.88 
 
 		 282 aa  201  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.89 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 		 279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.35 
 
 		 274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 		 281 aa  195  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.44 
 
 		 276 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 		 283 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 279 aa  192  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.49 
 
 		 285 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.24 
 
 		 293 aa  192  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 		 282 aa  192  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 		 276 aa  191  8e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.97 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.6 
 
 		 288 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.4 
 
 		 286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.61 
 
 		 295 aa  188  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 		 292 aa  186  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 277 aa  185  8e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.38 
 
 		 276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.17 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 		 276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  39.55 
 
 		 274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0757  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  38.65 
 
 		 282 aa  182  7e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0227485  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  41.61 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.05 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 		 280 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 		 291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 280 aa  179  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 		 286 aa  178  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.74 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.71 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 		 277 aa  172  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 		 274 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.01 
 
 		 299 aa  169  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  36.63 
 
 		 274 aa  168  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 		 273 aa  168  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135056  normal  0.0706675 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09347  conserved hypothetical protein  39.86 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.395404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 		 280 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  38.04 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.83 
 
 		 289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 		 283 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.73 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96036  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>