More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4746 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 293 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  97.95 
 
 		 293 aa  547  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  92.71 
 
 		 291 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  90.28 
 
 		 291 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  90.28 
 
 		 291 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  90.28 
 
 		 291 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.91 
 
 		 291 aa  319  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.45 
 
 		 290 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.36 
 
 		 282 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.35 
 
 		 282 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.34 
 
 		 289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 		 276 aa  249  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.17 
 
 		 292 aa  248  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.1 
 
 		 279 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.1 
 
 		 282 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 		 293 aa  244  9e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.59 
 
 		 278 aa  240  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.69 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  46.38 
 
 		 280 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  46.74 
 
 		 280 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  44.91 
 
 		 274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  44.91 
 
 		 274 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  44.91 
 
 		 274 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.5 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  41.16 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  43.82 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.6 
 
 		 283 aa  209  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.406068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  39.86 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 279 aa  206  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.59 
 
 		 286 aa  206  5e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 		 280 aa  205  8e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  42.12 
 
 		 280 aa  205  9e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.56 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.65 
 
 		 276 aa  203  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  39.13 
 
 		 284 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 		 287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.61 
 
 		 279 aa  200  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.16 
 
 		 290 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 		 286 aa  198  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.29 
 
 		 288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  43.23 
 
 		 285 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.09 
 
 		 284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  39.64 
 
 		 276 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.37 
 
 		 275 aa  195  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.58 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.52 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  41.24 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  41.49 
 
 		 280 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 		 277 aa  192  8e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  40.29 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.18 
 
 		 276 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3499  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.85 
 
 		 294 aa  189  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  39.1 
 
 		 282 aa  189  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 283 aa  189  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 		 272 aa  188  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.49 
 
 		 285 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 		 283 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  38.18 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.23 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.35 
 
 		 281 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6770  short chain dehydrogenase  40.15 
 
 		 276 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 		 279 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 		 281 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  40.79 
 
 		 279 aa  185  7e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 		 273 aa  185  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 		 281 aa  182  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966352 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.63 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  38.01 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.88 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 		 282 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.81 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.41 
 
 		 272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  37.45 
 
 		 284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 		 292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0160935 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  34.6 
 
 		 278 aa  179  4e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  39.93 
 
 		 284 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  40.65 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 		 280 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 		 281 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 276 aa  175  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 299 aa  175  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 		 281 aa  175  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  35.13 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0984  short chain dehydrogenase  37.82 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>