More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2331 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2331  short chain dehydrogenase  100 
 
 
285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6368  short chain dehydrogenase  75.74 
 
 
279 aa  418  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  63.04 
 
 
287 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  49.82 
 
 
285 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  48.9 
 
 
274 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  48.9 
 
 
274 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.85 
 
 
274 aa  256  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  48.9 
 
 
274 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.13 
 
 
273 aa  251  8.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  49.06 
 
 
274 aa  249  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  49.63 
 
 
283 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  48.56 
 
 
303 aa  236  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.35 
 
 
272 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.89 
 
 
272 aa  232  7.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  45.59 
 
 
282 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.19 
 
 
272 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
275 aa  223  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.07 
 
 
292 aa  208  8e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.89 
 
 
280 aa  203  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.88 
 
 
281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0885  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.2 
 
 
305 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  41.91 
 
 
286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.12 
 
 
273 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135056  normal  0.0706675 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 
276 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.31 
 
 
290 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
295 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  42.01 
 
 
280 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 
279 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.96 
 
 
290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.96 
 
 
290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.14 
 
 
286 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
282 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  40.36 
 
 
284 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  39.62 
 
 
280 aa  180  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
282 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  42.4 
 
 
279 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  40 
 
 
284 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.59 
 
 
279 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.54 
 
 
285 aa  178  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.81 
 
 
282 aa  178  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.59 
 
 
282 aa  178  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
287 aa  178  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 
279 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96036  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.35 
 
 
296 aa  178  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  40.38 
 
 
280 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  39.71 
 
 
276 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
281 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.966352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 
284 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 
279 aa  176  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12080  short-chain alcohol dehydrogenase  42.8 
 
 
266 aa  176  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.52 
 
 
282 aa  176  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
279 aa  175  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.49 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
276 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.27 
 
 
283 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366194  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
275 aa  172  7.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  38.71 
 
 
279 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  37.72 
 
 
276 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.12 
 
 
288 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
285 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
279 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 
290 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
289 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
283 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.99 
 
 
279 aa  169  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
279 aa  169  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
277 aa  169  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3237  short chain dehydrogenase  41.3 
 
 
274 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.996911 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.29 
 
 
291 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.29 
 
 
291 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  41.13 
 
 
847 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.29 
 
 
291 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 
282 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
277 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
278 aa  166  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0773345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  38.32 
 
 
277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37 
 
 
282 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.32 
 
 
279 aa  165  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
280 aa  165  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6770  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 
276 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3499  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.32 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.18 
 
 
279 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 
291 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.09 
 
 
274 aa  162  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
285 aa  161  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.239273 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0757  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  35.74 
 
 
282 aa  161  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0227485  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
283 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
281 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  39.04 
 
 
847 aa  159  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  40.33 
 
 
280 aa  158  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>