More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5466 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 283 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.47 
 
 		 283 aa  337  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.21 
 
 		 280 aa  271  7e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.52 
 
 		 281 aa  271  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.09 
 
 		 280 aa  264  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.57 
 
 		 279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.46 
 
 		 279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.12 
 
 		 280 aa  229  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.04 
 
 		 276 aa  228  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.55 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.96 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.17 
 
 		 277 aa  223  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.79 
 
 		 275 aa  220  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 		 285 aa  219  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.239273 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.52 
 
 		 283 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.96 
 
 		 279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.6 
 
 		 280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.89 
 
 		 282 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.85 
 
 		 285 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.49 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  44.33 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.61 
 
 		 274 aa  205  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 		 296 aa  205  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.03 
 
 		 279 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.09 
 
 		 279 aa  199  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.96 
 
 		 280 aa  199  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  40.07 
 
 		 280 aa  198  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 		 288 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 		 282 aa  195  6e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 		 276 aa  195  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  42.8 
 
 		 274 aa  193  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 		 287 aa  191  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.12 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  43.92 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  39.25 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  40.22 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  42.8 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.42 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.24 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 		 273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 		 282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  39.57 
 
 		 280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 		 285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  42.07 
 
 		 280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 286 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  40.66 
 
 		 277 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.24 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  40.8 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  39.93 
 
 		 284 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 		 292 aa  180  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0160935 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  39.33 
 
 		 284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.33 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.59 
 
 		 292 aa  179  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.44 
 
 		 281 aa  178  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966352 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  40.59 
 
 		 280 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8863  short chain dehydrogenase  40.44 
 
 		 282 aa  178  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 		 284 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  37.82 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.22 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  39.25 
 
 		 284 aa  176  3e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  40.22 
 
 		 276 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  41.64 
 
 		 279 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.52 
 
 		 281 aa  175  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3499  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 		 294 aa  175  9e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  40.86 
 
 		 274 aa  175  9e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.49 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  40.47 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.24 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.03 
 
 		 276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  40.47 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6368  short chain dehydrogenase  46.94 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2359  short chain dehydrogenase  37.09 
 
 		 277 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  39.85 
 
 		 277 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 		 279 aa  172  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  39.93 
 
 		 278 aa  171  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.87 
 
 		 295 aa  169  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 		 293 aa  170  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7039  short chain dehydrogenase  35.66 
 
 		 275 aa  169  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0246661  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0984  short chain dehydrogenase  40.07 
 
 		 283 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.49 
 
 		 284 aa  167  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6478  short chain dehydrogenase  39.11 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0193628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  37.04 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  36.46 
 
 		 287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 		 282 aa  165  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 		 281 aa  165  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>