More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0786 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
292 aa  588  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0160935 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.36 
 
 
284 aa  403  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3499  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.79 
 
 
294 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.23 
 
 
279 aa  225  9e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.95 
 
 
299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.88 
 
 
280 aa  211  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.43 
 
 
285 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.58 
 
 
281 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.54 
 
 
283 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.13 
 
 
280 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 
281 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.65 
 
 
276 aa  202  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 
282 aa  202  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.38 
 
 
287 aa  201  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  41.2 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.64 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.07 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
286 aa  199  5e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.24 
 
 
286 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.46 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  37.22 
 
 
278 aa  196  3e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.12 
 
 
276 aa  195  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.33 
 
 
279 aa  195  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.65 
 
 
277 aa  195  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 
289 aa  195  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
288 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.54 
 
 
283 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
274 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.96 
 
 
276 aa  193  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  43.49 
 
 
280 aa  192  4e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
282 aa  192  6e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
296 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.58 
 
 
282 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
275 aa  190  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  42.8 
 
 
280 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
276 aa  188  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  42.42 
 
 
280 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.16 
 
 
291 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.03 
 
 
282 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.91 
 
 
276 aa  185  9e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.35 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.03 
 
 
282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  40 
 
 
278 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
284 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
285 aa  182  6e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.239273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.6 
 
 
293 aa  182  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.52 
 
 
291 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.52 
 
 
291 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.52 
 
 
291 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
293 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  39.64 
 
 
284 aa  181  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.29 
 
 
283 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.65 
 
 
279 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 
285 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
293 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.79 
 
 
282 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
283 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366194  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  40.47 
 
 
284 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  41.47 
 
 
284 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.91 
 
 
281 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0757  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  36.36 
 
 
282 aa  176  3e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0227485  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 
280 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  40.44 
 
 
279 aa  175  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 
279 aa  175  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl172  dehydrogenase  36.58 
 
 
279 aa  175  9e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  41.91 
 
 
303 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  41.48 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.28 
 
 
290 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1152  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 
258 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.32 
 
 
284 aa  172  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.68 
 
 
280 aa  172  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  40.68 
 
 
274 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  40.68 
 
 
274 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  42.01 
 
 
285 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  40.68 
 
 
274 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
290 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 
276 aa  170  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
290 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.07 
 
 
295 aa  169  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 
344 aa  169  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  41.04 
 
 
274 aa  169  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  36.03 
 
 
275 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0984  short chain dehydrogenase  39.93 
 
 
283 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  39.23 
 
 
287 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
278 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  41.11 
 
 
276 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  39.62 
 
 
282 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.33 
 
 
279 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  40.22 
 
 
277 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.52 
 
 
279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7039  short chain dehydrogenase  35.47 
 
 
275 aa  165  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0246661  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  39.26 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.18 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.01823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>