More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1126 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
338 aa  682    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.5 
 
 
317 aa  462  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.88 
 
 
272 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.5 
 
 
306 aa  288  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.51 
 
 
278 aa  276  2e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.719818  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.28 
 
 
314 aa  257  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.82 
 
 
280 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.48 
 
 
285 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.300574 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.54 
 
 
285 aa  196  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.33 
 
 
300 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.52 
 
 
300 aa  187  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0898899  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2186  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40 
 
 
281 aa  186  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01319  short chain dehydrogenase  38.81 
 
 
275 aa  186  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  37.32 
 
 
283 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3160  short chain dehydrogenase  38.2 
 
 
258 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1270  short chain dehydrogenase  38.2 
 
 
258 aa  184  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3022  short chain dehydrogenase  38.2 
 
 
258 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.515629  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  36.96 
 
 
283 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004148  putative oxidoreductase  37.87 
 
 
275 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3006  short chain dehydrogenase  38.72 
 
 
258 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.662258  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.87 
 
 
280 aa  181  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0560563  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  39.93 
 
 
287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0805  short chain dehydrogenase  35.69 
 
 
275 aa  179  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0554  short chain dehydrogenase  38.2 
 
 
256 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0613  short chain dehydrogenase  38.2 
 
 
256 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0569  short chain dehydrogenase  38.2 
 
 
256 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0552  short chain dehydrogenase  38.2 
 
 
256 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0559  short chain dehydrogenase  38.2 
 
 
256 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1156  short chain dehydrogenase  38.35 
 
 
258 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565879  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.41 
 
 
272 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1053  short chain dehydrogenase  39.08 
 
 
258 aa  177  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  38.91 
 
 
275 aa  176  6e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  37.74 
 
 
277 aa  176  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  37.99 
 
 
272 aa  176  6e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1140  short-chain dehydrogenase/reductase  39.23 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0967  short chain dehydrogenase  37.22 
 
 
256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  42.05 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0572  short chain dehydrogenase  36.94 
 
 
269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  36.09 
 
 
276 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00444  short chain dehydrogenase  36.94 
 
 
269 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0532  short chain dehydrogenase  36.94 
 
 
269 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00449  hypothetical protein  36.94 
 
 
269 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
278 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0428  short chain dehydrogenase  36.94 
 
 
269 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0597  short chain dehydrogenase  36.94 
 
 
269 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.853747 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
286 aa  173  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.94 
 
 
256 aa  172  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3123  short chain dehydrogenase  36.94 
 
 
256 aa  173  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111305 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  36 
 
 
291 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1977  short chain dehydrogenase  38.11 
 
 
280 aa  172  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 
291 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1902  short chain dehydrogenase  38.11 
 
 
280 aa  172  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3194  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 
256 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 
281 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  40.98 
 
 
279 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0542  short chain dehydrogenase  36.57 
 
 
256 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0500  short chain dehydrogenase  36.09 
 
 
275 aa  172  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  35.45 
 
 
276 aa  170  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
272 aa  169  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  35.64 
 
 
291 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1005  short chain dehydrogenase  37.83 
 
 
284 aa  169  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
281 aa  169  8e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
280 aa  169  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1121  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 
256 aa  168  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0921359  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  35.36 
 
 
291 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  41.37 
 
 
276 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3557  short chain dehydrogenase  36.6 
 
 
277 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18665  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3850  short chain dehydrogenase  37.12 
 
 
277 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  34.88 
 
 
291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  39.54 
 
 
277 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  35.36 
 
 
291 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37 
 
 
276 aa  166  5e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
278 aa  166  6.9999999999999995e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3029  short chain dehydrogenase  36.75 
 
 
277 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.430063  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  34.04 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  34.55 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  39.41 
 
 
268 aa  164  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  38.83 
 
 
278 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  38.35 
 
 
279 aa  164  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  35 
 
 
291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.21 
 
 
275 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  37.12 
 
 
283 aa  163  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1694  short-chain dehydrogenase/reductase  37.5 
 
 
271 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4006  short chain dehydrogenase  36.43 
 
 
277 aa  162  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
279 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
271 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0407842  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 
283 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
285 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  37.59 
 
 
344 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
282 aa  160  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 
286 aa  159  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
269 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  37.02 
 
 
280 aa  159  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  36.9 
 
 
284 aa  159  8e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0220  putative oxidoreductase NAD-/NADP-dependent  36.57 
 
 
277 aa  159  9e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
273 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>