More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1648 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  575  1.0000000000000001e-163  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  98.23 
 
 
283 aa  565  1e-160  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2186  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  53.7 
 
 
281 aa  297  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.46 
 
 
300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0898899  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 
286 aa  275  8e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1140  short-chain dehydrogenase/reductase  50.36 
 
 
279 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.79 
 
 
276 aa  264  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.46 
 
 
290 aa  258  9e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.46 
 
 
285 aa  257  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0805  short chain dehydrogenase  46.99 
 
 
275 aa  255  5e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.01 
 
 
286 aa  252  4.0000000000000004e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.51 
 
 
277 aa  249  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.191089 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4006  short chain dehydrogenase  47.79 
 
 
277 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.27 
 
 
282 aa  247  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.39 
 
 
281 aa  246  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01319  short chain dehydrogenase  45.72 
 
 
275 aa  245  4.9999999999999997e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.01 
 
 
275 aa  244  9e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1219  peptidoglycan-binding LysM  46.32 
 
 
280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.370987  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004148  putative oxidoreductase  44.98 
 
 
275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0220  putative oxidoreductase NAD-/NADP-dependent  43.96 
 
 
277 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 
271 aa  242  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.566355  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.61 
 
 
271 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0407842  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0500  short chain dehydrogenase  44.28 
 
 
275 aa  240  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1694  short-chain dehydrogenase/reductase  44.24 
 
 
271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1121  short chain dehydrogenase  46.84 
 
 
256 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0921359  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1977  short chain dehydrogenase  45.72 
 
 
280 aa  230  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1902  short chain dehydrogenase  45.72 
 
 
280 aa  230  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1005  short chain dehydrogenase  46.44 
 
 
284 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3006  short chain dehydrogenase  45.35 
 
 
258 aa  229  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.662258  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3194  short chain dehydrogenase  46.1 
 
 
256 aa  228  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234456  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3557  short chain dehydrogenase  45.76 
 
 
277 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18665  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3850  short chain dehydrogenase  45.22 
 
 
277 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3029  short chain dehydrogenase  43.54 
 
 
277 aa  226  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.430063  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0967  short chain dehydrogenase  44.61 
 
 
256 aa  226  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0554  short chain dehydrogenase  43.12 
 
 
256 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0613  short chain dehydrogenase  43.12 
 
 
256 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0569  short chain dehydrogenase  43.12 
 
 
256 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0552  short chain dehydrogenase  43.12 
 
 
256 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0559  short chain dehydrogenase  43.12 
 
 
256 aa  225  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1053  short chain dehydrogenase  44.61 
 
 
258 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3160  short chain dehydrogenase  44.98 
 
 
258 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1270  short chain dehydrogenase  44.98 
 
 
258 aa  223  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3022  short chain dehydrogenase  44.98 
 
 
258 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.515629  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2528  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 
277 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.589688 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.59 
 
 
272 aa  219  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00444  short chain dehydrogenase  42.38 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0532  short chain dehydrogenase  42.38 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0428  short chain dehydrogenase  42.38 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3123  short chain dehydrogenase  42.38 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111305 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00449  hypothetical protein  42.38 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0542  short chain dehydrogenase  42.38 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0572  short chain dehydrogenase  42.01 
 
 
269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.01 
 
 
256 aa  212  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0597  short chain dehydrogenase  42.01 
 
 
269 aa  212  7e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.853747 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1156  short chain dehydrogenase  43.23 
 
 
258 aa  208  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565879  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  39.86 
 
 
279 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  38.83 
 
 
273 aa  188  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  39.13 
 
 
279 aa  186  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  39.56 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.32 
 
 
338 aa  183  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 
317 aa  177  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  39.56 
 
 
278 aa  176  4e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
314 aa  175  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  35.38 
 
 
287 aa  175  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 
277 aa  175  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  38.6 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.59 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.41 
 
 
285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.300574 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  35.69 
 
 
278 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0876  short chain dehydrogenase  39.16 
 
 
274 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
300 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  36.9 
 
 
277 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.18 
 
 
285 aa  165  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  35.69 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  37.6 
 
 
275 aa  162  7e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  37.55 
 
 
277 aa  162  8.000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
267 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  40.66 
 
 
270 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 
291 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.63 
 
 
276 aa  160  3e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  40.25 
 
 
270 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  36.3 
 
 
291 aa  158  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 
291 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  35.94 
 
 
291 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  36.3 
 
 
291 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
272 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  36.3 
 
 
281 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  35.94 
 
 
291 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
305 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0783167 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  35.59 
 
 
291 aa  155  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  40.66 
 
 
270 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  34.98 
 
 
276 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.3 
 
 
275 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  35.23 
 
 
291 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  35.46 
 
 
291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
268 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1223  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  43.72 
 
 
272 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 
275 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158642  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
291 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  35.53 
 
 
276 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>