More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1352 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  100 
 
 		 275 aa  557  1e-158  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  44.28 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.18 
 
 		 291 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  40.22 
 
 		 273 aa  202  3e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  41.54 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  40.87 
 
 		 276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  39.33 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  43.95 
 
 		 278 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  37.64 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  43.48 
 
 		 287 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  41.43 
 
 		 279 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.16 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 		 285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.64 
 
 		 314 aa  182  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  41.46 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  41.64 
 
 		 277 aa  181  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.07 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  38.81 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  42.21 
 
 		 279 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.05 
 
 		 338 aa  176  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 		 277 aa  175  7e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 317 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3194  short chain dehydrogenase  40.07 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234456  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  40.53 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1121  short chain dehydrogenase  39.7 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0921359  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0967  short chain dehydrogenase  39.7 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.48 
 
 		 285 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.300574 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.25 
 
 		 272 aa  165  8e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 		 272 aa  165  9e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  37.6 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  37.13 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0876  short chain dehydrogenase  39.93 
 
 		 274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0065  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  37.76 
 
 		 274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3006  short chain dehydrogenase  38.43 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.662258  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  34.88 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  37.41 
 
 		 270 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  37.6 
 
 		 283 aa  162  7e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.05 
 
 		 275 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  36.33 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1270  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1053  short chain dehydrogenase  37.69 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3022  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.515629  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3160  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140307  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  40.46 
 
 		 277 aa  159  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2186  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.49 
 
 		 281 aa  157  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1156  short chain dehydrogenase  39 
 
 		 258 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565879  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3029  short chain dehydrogenase  37.09 
 
 		 277 aa  156  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.430063  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  39.51 
 
 		 284 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 305 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0783167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1223  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  38.06 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1049  short chain dehydrogenase  37.59 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  38.06 
 
 		 270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4006  short chain dehydrogenase  36.03 
 
 		 277 aa  152  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1018  short chain dehydrogenase  45.56 
 
 		 298 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176999  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  37.17 
 
 		 286 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 		 300 aa  152  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0898899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 		 284 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  35.96 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  37.78 
 
 		 270 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  32.98 
 
 		 280 aa  152  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 272 aa  152  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  37.78 
 
 		 270 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  35.19 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.49 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  32.75 
 
 		 291 aa  149  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  38.37 
 
 		 284 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0554  short chain dehydrogenase  36.7 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0552  short chain dehydrogenase  36.7 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0613  short chain dehydrogenase  36.7 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0569  short chain dehydrogenase  36.7 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  33.09 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  33.09 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  33.1 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0559  short chain dehydrogenase  36.7 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  35.97 
 
 		 274 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 271 aa  148  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1140  short-chain dehydrogenase/reductase  38.78 
 
 		 279 aa  149  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 		 278 aa  148  8e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.719818  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1977  short chain dehydrogenase  36.95 
 
 		 280 aa  148  9e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 		 271 aa  148  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 		 279 aa  148  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1902  short chain dehydrogenase  36.95 
 
 		 280 aa  148  9e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 280 aa  148  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 		 286 aa  148  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.406068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>