More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1905 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  100 
 
 
280 aa  579  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  76.7 
 
 
291 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  76.7 
 
 
291 aa  463  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  76.7 
 
 
291 aa  461  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  76.7 
 
 
281 aa  463  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  77.06 
 
 
291 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  76.7 
 
 
291 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  76.7 
 
 
291 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  75.99 
 
 
291 aa  454  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  77.06 
 
 
291 aa  456  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  75.27 
 
 
291 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  49.82 
 
 
286 aa  287  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  41.01 
 
 
344 aa  228  8e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4067  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  38.95 
 
 
298 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122191  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  37.18 
 
 
273 aa  176  4e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  34.88 
 
 
278 aa  175  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.46 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.64 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 
278 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
268 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.83 
 
 
268 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.83 
 
 
268 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  36.13 
 
 
283 aa  169  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  35.51 
 
 
287 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 
314 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  35.23 
 
 
279 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 
300 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.92 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.49 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  34.4 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  32.98 
 
 
277 aa  163  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  34.98 
 
 
277 aa  163  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
317 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
286 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.82 
 
 
291 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
338 aa  159  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  35.02 
 
 
278 aa  157  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0065  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  38.06 
 
 
274 aa  156  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 
276 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  34.78 
 
 
274 aa  153  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.59 
 
 
268 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
269 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 
282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  35.84 
 
 
272 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
298 aa  152  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 
272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  34.67 
 
 
283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  36.43 
 
 
277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
271 aa  152  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  32.98 
 
 
275 aa  152  8.999999999999999e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
267 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  31.18 
 
 
272 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
267 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
284 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  38.28 
 
 
285 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6478  short chain dehydrogenase  35.8 
 
 
277 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0193628  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.98 
 
 
271 aa  149  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  34.31 
 
 
283 aa  149  7e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8863  short chain dehydrogenase  36.25 
 
 
282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  36.63 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  33.21 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  36.63 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  36.63 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
277 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 
276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  38.36 
 
 
280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 
282 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  35.8 
 
 
277 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 
268 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 
287 aa  142  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
281 aa  143  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  34.56 
 
 
274 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  34.56 
 
 
274 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 
282 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
271 aa  142  5e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
289 aa  142  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  34.56 
 
 
274 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  34.51 
 
 
304 aa  142  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  37.16 
 
 
284 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
266 aa  142  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.0308076 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.9 
 
 
282 aa  142  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.01 
 
 
275 aa  142  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  31.79 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  36.92 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  35.8 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  32.75 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0984  short chain dehydrogenase  32.85 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0718028  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  33.22 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  32.61 
 
 
282 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 
286 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
292 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.24 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  38.19 
 
 
276 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 
277 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>