More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3849 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 314 aa  612  9.999999999999999e-175  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.66 
 
 		 317 aa  259  6e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.28 
 
 		 338 aa  257  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.71 
 
 		 306 aa  256  4e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.56 
 
 		 272 aa  251  8.000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.79 
 
 		 278 aa  238  1e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.719818  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  44.07 
 
 		 278 aa  206  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  42.42 
 
 		 278 aa  205  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  42.01 
 
 		 287 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  41.09 
 
 		 273 aa  204  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  43.24 
 
 		 283 aa  203  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  42.64 
 
 		 279 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  41.39 
 
 		 279 aa  196  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.26 
 
 		 280 aa  195  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.92 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.62 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  36.8 
 
 		 272 aa  189  5.999999999999999e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.99 
 
 		 285 aa  186  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.300574 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  41.35 
 
 		 271 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.87 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 		 273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.48 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.94 
 
 		 280 aa  183  3e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0560563  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  41.64 
 
 		 275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  40.45 
 
 		 272 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.26 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  39.11 
 
 		 276 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.56 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  39.86 
 
 		 277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 		 275 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  33.1 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  37.41 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2186  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.93 
 
 		 281 aa  177  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  37.14 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  37.73 
 
 		 278 aa  177  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  37.14 
 
 		 283 aa  175  7e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  33.68 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  36.74 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.45 
 
 		 276 aa  172  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  33.92 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  33.45 
 
 		 291 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 		 271 aa  172  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  42.23 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3557  short chain dehydrogenase  40.43 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18665  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  45.53 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  39.43 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  31.94 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1977  short chain dehydrogenase  39.26 
 
 		 280 aa  170  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  32.06 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1902  short chain dehydrogenase  39.26 
 
 		 280 aa  170  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  40.38 
 
 		 272 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1005  short chain dehydrogenase  39.85 
 
 		 284 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.89 
 
 		 291 aa  169  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.56 
 
 		 276 aa  169  5e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  32.75 
 
 		 291 aa  169  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  39.62 
 
 		 286 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  33.1 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  31.72 
 
 		 291 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.87 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0898899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4006  short chain dehydrogenase  40.59 
 
 		 277 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3850  short chain dehydrogenase  39.19 
 
 		 277 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  34.17 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  37.59 
 
 		 268 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0718028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 		 270 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.27 
 
 		 275 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158642  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  41.43 
 
 		 284 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3029  short chain dehydrogenase  38.93 
 
 		 277 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.430063  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1140  short-chain dehydrogenase/reductase  41.18 
 
 		 279 aa  165  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 		 274 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.71 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2528  short chain dehydrogenase  40.39 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.589688 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0805  short chain dehydrogenase  34.2 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  34.32 
 
 		 272 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 		 272 aa  163  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004148  putative oxidoreductase  35.93 
 
 		 275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 		 275 aa  162  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 		 290 aa  162  8.000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  37.41 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01319  short chain dehydrogenase  35.93 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  34.36 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 		 268 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.93 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  35 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 277 aa  159  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.191089 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 		 275 aa  159  8e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.98 
 
 		 273 aa  158  9e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  36.7 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.63 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  37.69 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  41.23 
 
 		 268 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>