More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2235 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 266 aa  537  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  43.87 
 
 		 272 aa  239  5e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.45 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  45.11 
 
 		 304 aa  232  6e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 		 273 aa  228  6e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.16 
 
 		 291 aa  192  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0718028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  37.64 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  37.63 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.53 
 
 		 269 aa  159  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  36 
 
 		 277 aa  159  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  36.98 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  35.61 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.46 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 314 aa  155  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  33.82 
 
 		 283 aa  156  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  35.66 
 
 		 279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 		 268 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.07 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  34.31 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.32 
 
 		 272 aa  152  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  35.45 
 
 		 270 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  36.06 
 
 		 270 aa  152  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  37.04 
 
 		 268 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  36.53 
 
 		 847 aa  152  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  34.59 
 
 		 286 aa  151  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0876  short chain dehydrogenase  34.2 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  36.53 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.71 
 
 		 279 aa  148  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 		 268 aa  148  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  33.57 
 
 		 278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  34.17 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0942  short chain dehydrogenase  34.08 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  35.06 
 
 		 283 aa  146  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  33.81 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0685  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.2 
 
 		 265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  35.06 
 
 		 283 aa  145  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  34.18 
 
 		 279 aa  145  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  35.48 
 
 		 284 aa  145  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 306 aa  145  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  37.15 
 
 		 847 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.4 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  34.44 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  31.41 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 		 272 aa  142  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 		 286 aa  142  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  34.17 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 		 338 aa  141  9e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  33.82 
 
 		 344 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5364  short chain dehydrogenase  39.15 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.94 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 		 281 aa  139  4.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 276 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 		 273 aa  138  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  38.42 
 
 		 277 aa  138  7e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  32.71 
 
 		 270 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01319  short chain dehydrogenase  33.58 
 
 		 275 aa  138  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4067  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.46 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122191  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  32.84 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.83 
 
 		 276 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0065  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  34.45 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.05 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  31.97 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 		 297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000449491  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  32.62 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3322  short chain dehydrogenase  32.55 
 
 		 268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0896668  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1223  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.07 
 
 		 272 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0805  short chain dehydrogenase  32.73 
 
 		 275 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 		 280 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  32.62 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1018  short chain dehydrogenase  33.61 
 
 		 298 aa  135  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176999  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 		 267 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  32.97 
 
 		 291 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.14 
 
 		 275 aa  135  8e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158642  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  31.6 
 
 		 270 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  32 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6530  short chain dehydrogenase  32.82 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.744865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1049  short chain dehydrogenase  33.7 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0945  short chain dehydrogenase  40.66 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.566355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.184253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6137  short chain dehydrogenase  32.82 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  0.683407 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  31.79 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 		 276 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  30.42 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1694  short-chain dehydrogenase/reductase  32.62 
 
 		 271 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3447  short chain dehydrogenase  38.73 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>