More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4067 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4067  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  100 
 
 		 298 aa  623  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122191  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.62 
 
 		 268 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.62 
 
 		 268 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.67 
 
 		 268 aa  374  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  41.44 
 
 		 272 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  38.63 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  38.99 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  38.95 
 
 		 280 aa  185  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  37.63 
 
 		 291 aa  185  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  37.18 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  37.97 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  38.13 
 
 		 271 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  37.18 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  34.72 
 
 		 272 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  36.82 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  38.11 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  36.82 
 
 		 281 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  36.46 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.55 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  37.02 
 
 		 286 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  36.27 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  37.09 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.26 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  37.93 
 
 		 274 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5364  short chain dehydrogenase  40.83 
 
 		 270 aa  168  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0942  short chain dehydrogenase  37.3 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  36.92 
 
 		 284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 268 aa  162  6e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.74 
 
 		 271 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 		 275 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 		 268 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  33.33 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 		 273 aa  158  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 		 273 aa  158  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  39.46 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  36.78 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  35.74 
 
 		 304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.85 
 
 		 270 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  37.67 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.76 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  35.83 
 
 		 282 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0984  short chain dehydrogenase  36.82 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  37.66 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  36.82 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  34.6 
 
 		 270 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  34.05 
 
 		 273 aa  149  6e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 283 aa  148  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  34.18 
 
 		 278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 		 277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3447  short chain dehydrogenase  37.74 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  35.15 
 
 		 276 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.32 
 
 		 275 aa  146  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158642  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  33.21 
 
 		 276 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  35.96 
 
 		 277 aa  145  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 		 280 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  34.73 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  31.8 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 		 284 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  36.17 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8863  short chain dehydrogenase  37.35 
 
 		 282 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6530  short chain dehydrogenase  36.79 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.744865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6137  short chain dehydrogenase  36.79 
 
 		 268 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  0.683407 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1300  short chain dehydrogenase  36.79 
 
 		 268 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.21 
 
 		 276 aa  142  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.86 
 
 		 273 aa  142  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.23 
 
 		 271 aa  142  5e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3194  short chain dehydrogenase  33.71 
 
 		 256 aa  142  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234456  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  36.17 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  36.17 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 		 273 aa  142  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 		 278 aa  142  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0554  short chain dehydrogenase  35.45 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0552  short chain dehydrogenase  35.45 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0559  short chain dehydrogenase  35.45 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0569  short chain dehydrogenase  35.45 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0613  short chain dehydrogenase  35.45 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  34.13 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  35.56 
 
 		 276 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0967  short chain dehydrogenase  35.47 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0160935 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  33.09 
 
 		 275 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.82 
 
 		 317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1053  short chain dehydrogenase  34.33 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>