More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6416 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 307 aa  617  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  97.72 
 
 		 307 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  97.72 
 
 		 307 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.75 
 
 		 287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.24 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000449491  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.335118 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2693  putative short chain oxidoreductase  42.86 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233392  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 		 285 aa  183  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.29 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5812  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.18 
 
 		 299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 		 287 aa  179  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3013  putative oxidoreductase, short- chain dehydrogenase/reductase  42.05 
 
 		 321 aa  178  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.55 
 
 		 291 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.387596  hitchhiker  0.000782233 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 292 aa  176  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 		 308 aa  175  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.95 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.95 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.61 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.61 
 
 		 299 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.28 
 
 		 329 aa  172  7.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.32 
 
 		 302 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0942  short chain dehydrogenase  39.58 
 
 		 268 aa  168  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.63 
 
 		 271 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.89 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0553918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3447  short chain dehydrogenase  39.26 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  37.66 
 
 		 268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  39.66 
 
 		 268 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5364  short chain dehydrogenase  42.31 
 
 		 270 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 		 299 aa  162  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  47.19 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  37.07 
 
 		 286 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  47.09 
 
 		 271 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 		 272 aa  159  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 		 272 aa  159  7e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.14 
 
 		 308 aa  159  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000847254  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  43.85 
 
 		 270 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  39.74 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.84 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.65 
 
 		 273 aa  154  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  39 
 
 		 287 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3322  short chain dehydrogenase  41.33 
 
 		 268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0896668  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  39.15 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  37.88 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  46.02 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.93 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  36.12 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 		 344 aa  149  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 		 314 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  39.74 
 
 		 286 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6530  short chain dehydrogenase  40.35 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.744865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  38.34 
 
 		 272 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 		 279 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1300  short chain dehydrogenase  40.35 
 
 		 268 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 		 280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6137  short chain dehydrogenase  39.91 
 
 		 268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  0.683407 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  40.18 
 
 		 272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  38.75 
 
 		 284 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 		 272 aa  145  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  34.72 
 
 		 279 aa  145  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 338 aa  145  9e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  35.74 
 
 		 278 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.54 
 
 		 282 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0718028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.62 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.22 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  38.33 
 
 		 847 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.05 
 
 		 285 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  31.82 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 		 268 aa  143  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 272 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  32.98 
 
 		 273 aa  142  5e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  34.77 
 
 		 278 aa  142  6e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  41.94 
 
 		 278 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  34.26 
 
 		 291 aa  142  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 		 300 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.43 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  34.26 
 
 		 291 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  43.48 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  42.78 
 
 		 277 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  34.26 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  43.62 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  39.69 
 
 		 274 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 274 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>