More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2894 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
287 aa  584  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.41 
 
 
307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.64 
 
 
307 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.64 
 
 
307 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 
287 aa  203  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.63 
 
 
285 aa  193  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
297 aa  175  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000449491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
291 aa  175  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.387596  hitchhiker  0.000782233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 
292 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.52 
 
 
271 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3013  putative oxidoreductase, short- chain dehydrogenase/reductase  35.93 
 
 
321 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2693  putative short chain oxidoreductase  35.81 
 
 
299 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233392  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0942  short chain dehydrogenase  36.04 
 
 
268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  34.77 
 
 
279 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 
301 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 
282 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 
302 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 
297 aa  150  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.335118 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  42.86 
 
 
270 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  34.28 
 
 
287 aa  149  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 
308 aa  149  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  41.3 
 
 
273 aa  149  7e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
276 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
308 aa  148  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000847254  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 
283 aa  148  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  34.14 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.7 
 
 
271 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
291 aa  146  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
272 aa  144  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
276 aa  144  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.56 
 
 
272 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  42.54 
 
 
270 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5812  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
299 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
299 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
299 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
299 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337193  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 
344 aa  143  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
269 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.11 
 
 
329 aa  142  6e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  36.46 
 
 
272 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
291 aa  142  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0718028  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.54 
 
 
272 aa  142  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  37.02 
 
 
268 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  32.26 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  38.95 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  40.64 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  30.47 
 
 
278 aa  140  3e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  41.01 
 
 
268 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.39 
 
 
317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 
291 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  33.78 
 
 
291 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  33.78 
 
 
291 aa  139  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  33.78 
 
 
281 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1020  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
273 aa  138  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0196176  normal  0.613777 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  38.62 
 
 
271 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  33.78 
 
 
291 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
275 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
281 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  34.84 
 
 
277 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  33.78 
 
 
291 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
297 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
291 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  36.02 
 
 
847 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.71 
 
 
306 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.01 
 
 
300 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  33.78 
 
 
291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.67 
 
 
273 aa  136  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 
291 aa  136  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 
299 aa  136  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
276 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
338 aa  135  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.09 
 
 
299 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.84 
 
 
275 aa  135  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158642  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  40.11 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
268 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  32.43 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02393  short chain oxidoreductase/dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01770)  37.74 
 
 
287 aa  133  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930439  normal  0.559669 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  35.77 
 
 
272 aa  133  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
271 aa  132  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 
267 aa  132  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.06 
 
 
268 aa  132  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  40.96 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5364  short chain dehydrogenase  36.21 
 
 
270 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.11 
 
 
292 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 
266 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 
273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135056  normal  0.0706675 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  36.62 
 
 
274 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  35.42 
 
 
847 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  36.25 
 
 
279 aa  128  8.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 
273 aa  129  8.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 
284 aa  128  9.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 
273 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  39.78 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>