More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1307 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
299 aa  586  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.46 
 
 
308 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.51 
 
 
297 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.335118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.86 
 
 
308 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000847254  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2693  putative short chain oxidoreductase  63.73 
 
 
299 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233392  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.97 
 
 
299 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.97 
 
 
299 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.49 
 
 
300 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0553918 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5812  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.01 
 
 
299 aa  348  8e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.52 
 
 
301 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.27 
 
 
299 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337193  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.93 
 
 
299 aa  338  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.23 
 
 
297 aa  335  3.9999999999999995e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.36 
 
 
302 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3013  putative oxidoreductase, short- chain dehydrogenase/reductase  53.58 
 
 
321 aa  299  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.61 
 
 
201 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
296 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0965696 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.51 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.51 
 
 
307 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.51 
 
 
307 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 
297 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000449491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
291 aa  149  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.387596  hitchhiker  0.000782233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 
287 aa  145  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
292 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
272 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
267 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.14 
 
 
271 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
271 aa  109  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  36.51 
 
 
279 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  32.28 
 
 
286 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 
272 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  35.47 
 
 
272 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 
273 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135056  normal  0.0706675 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
338 aa  106  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 
266 aa  106  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  34.58 
 
 
268 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 
317 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
281 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  32.44 
 
 
304 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 
329 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.42 
 
 
276 aa  103  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
281 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
279 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  34.88 
 
 
279 aa  102  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.92 
 
 
270 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 
282 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  27.82 
 
 
278 aa  102  1e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
247 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
272 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
314 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  31.15 
 
 
268 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.62 
 
 
276 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4835  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.45 
 
 
273 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000227026 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 
242 aa  100  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 
273 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
278 aa  99.8  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.719818  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
280 aa  99.8  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 
265 aa  99.8  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  35.79 
 
 
284 aa  99.4  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
306 aa  99.4  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 
273 aa  99.4  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 
280 aa  99  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
252 aa  99  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5364  short chain dehydrogenase  36.06 
 
 
270 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  34.04 
 
 
270 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  36.27 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 
275 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.593467  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25.76 
 
 
275 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158642  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  37.63 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
286 aa  96.3  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
269 aa  96.7  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
248 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.23 
 
 
282 aa  96.3  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
272 aa  95.9  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  31.42 
 
 
278 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.77 
 
 
285 aa  95.9  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.57 
 
 
286 aa  95.9  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.866601  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  28.4 
 
 
277 aa  95.9  8e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  36.02 
 
 
271 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  35.48 
 
 
272 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
285 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  31.48 
 
 
268 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.26 
 
 
273 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  24.9 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  24.9 
 
 
281 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  30.89 
 
 
344 aa  95.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
250 aa  95.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 
275 aa  95.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  31.84 
 
 
847 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  36.13 
 
 
272 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 
295 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 
275 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>