More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2693 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2693  putative short chain oxidoreductase  100 
 
 
299 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233392  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.69 
 
 
297 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.335118 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.91 
 
 
297 aa  403  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5812  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.86 
 
 
299 aa  391  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.54 
 
 
299 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337193  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.54 
 
 
299 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.54 
 
 
299 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.85 
 
 
299 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.74 
 
 
301 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.18 
 
 
300 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0553918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.73 
 
 
299 aa  349  4e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.86 
 
 
308 aa  323  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.12 
 
 
308 aa  316  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000847254  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.59 
 
 
302 aa  308  5.9999999999999995e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3013  putative oxidoreductase, short- chain dehydrogenase/reductase  52.17 
 
 
321 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.51 
 
 
201 aa  189  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
307 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.52 
 
 
307 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.52 
 
 
307 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
291 aa  168  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.387596  hitchhiker  0.000782233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.15 
 
 
297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000449491  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
296 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0965696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.81 
 
 
287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
287 aa  142  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.15 
 
 
292 aa  132  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  37.14 
 
 
286 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5364  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
270 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  38.32 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  31.89 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  38.5 
 
 
270 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
268 aa  113  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
329 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0942  short chain dehydrogenase  34.55 
 
 
268 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  33.97 
 
 
304 aa  109  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.01 
 
 
273 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.6 
 
 
271 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
286 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  31.76 
 
 
344 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  39.57 
 
 
272 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 
283 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  37.57 
 
 
279 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  34.43 
 
 
268 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
281 aa  106  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
306 aa  106  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  39.04 
 
 
272 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 
268 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
275 aa  104  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4067  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  31.72 
 
 
298 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122191  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  30.53 
 
 
278 aa  104  2e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  29.39 
 
 
280 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  39.38 
 
 
271 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
268 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  35.1 
 
 
272 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
272 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  37.04 
 
 
279 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 
275 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 
271 aa  103  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.42 
 
 
281 aa  102  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
276 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 
338 aa  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 
285 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  39.27 
 
 
274 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
273 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
273 aa  102  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
269 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  38.02 
 
 
276 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
280 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.47 
 
 
267 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  28.08 
 
 
291 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6770  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 
276 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
273 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135056  normal  0.0706675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 
295 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
271 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  32.43 
 
 
280 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
282 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
342 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
280 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  33.82 
 
 
272 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  30.23 
 
 
273 aa  100  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 
268 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  37.89 
 
 
278 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
273 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  35.98 
 
 
278 aa  99.8  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  38.62 
 
 
287 aa  99.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
279 aa  99.4  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  27.42 
 
 
291 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 
271 aa  99.4  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 
282 aa  99  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 
271 aa  99  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
242 aa  98.6  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3447  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 
268 aa  98.6  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
284 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1825  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 
278 aa  98.2  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356255  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  26.92 
 
 
291 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
283 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>