More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3399 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
243 aa  483  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.05 
 
 
240 aa  306  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.54 
 
 
259 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0733  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.54 
 
 
259 aa  261  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548122  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2241  putative short chain dehydrogenase  53.94 
 
 
255 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
257 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2697  putative daunorubicin C-13 ketoreductase  49.41 
 
 
257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114176  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2020  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
257 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07799  Uncharacterized oxidoreductase AN7799 (EC 1.-.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AV81]  37.65 
 
 
255 aa  150  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.480251 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05368  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00440)  41.1 
 
 
261 aa  145  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10208  probable oxidoreductase  31.79 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.13 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.68 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43764  predicted protein  26.69 
 
 
365 aa  77.8  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.24 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.512596 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.278197 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.57 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1354  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.02424  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.52 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1959  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.24 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.59 
 
 
292 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.14 
 
 
269 aa  64.7  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
281 aa  63.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05400  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  33.95 
 
 
274 aa  63.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.46 
 
 
268 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.21 
 
 
245 aa  63.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5377  putative retinol dehydrogenase  27.57 
 
 
296 aa  62.4  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.637386  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1945  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
227 aa  61.6  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.23 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  27.41 
 
 
316 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.86 
 
 
238 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.87 
 
 
298 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28998  predicted protein  29.19 
 
 
283 aa  59.7  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275972  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.82 
 
 
237 aa  58.9  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.8 
 
 
289 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.8 
 
 
289 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.8 
 
 
289 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2660  short chain dehydrogenase  28.14 
 
 
276 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219801  unclonable  0.0000000271181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
336 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.75 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.81 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0772847  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 
266 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.15 
 
 
233 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 
292 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.204462 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 
239 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2307  short chain dehydrogenase  29.95 
 
 
253 aa  57  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2697  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  28.87 
 
 
247 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1926  short chain dehydrogenase  29.95 
 
 
253 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.641553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.15 
 
 
227 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2037  short chain dehydrogenase  29.95 
 
 
253 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.317524  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  26.87 
 
 
363 aa  56.6  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  26.87 
 
 
363 aa  56.6  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0665  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  26.94 
 
 
246 aa  56.6  0.0000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.719138  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 
271 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196171  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08791  short-chain dehydrogenase/reductase  24.58 
 
 
221 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.02 
 
 
292 aa  55.5  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.18 
 
 
297 aa  55.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.13 
 
 
251 aa  55.5  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  30.19 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.77 
 
 
246 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.19 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38394  predicted protein  27.35 
 
 
276 aa  54.7  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00142595  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.84 
 
 
253 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16282  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0925  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.8 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.568448  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
263 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0501605 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.59 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07551  short-chain dehydrogenase/reductase  23.08 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.59 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24130  short-chain alcohol dehydrogenase  39.51 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01679  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase  27.63 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.27 
 
 
288 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.73 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 
251 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0705  short-chain dehydrogenase/reductase  24.37 
 
 
221 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.096337  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  26.67 
 
 
309 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1086  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  35.42 
 
 
247 aa  53.5  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.144372  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.5 
 
 
240 aa  53.5  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.98 
 
 
242 aa  52.8  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00878668  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.15 
 
 
273 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 
273 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  0.457646 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 
270 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212781  normal  0.926969 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.48 
 
 
292 aa  53.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0384845  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 
273 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04541  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  26.53 
 
 
250 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0716484  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3563  p-cumic alcohol dehydrogenase (CymB)  27.23 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.822337  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1844  gluconate 5-dehydrogenase  27.69 
 
 
263 aa  52.8  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250447  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 
250 aa  52.8  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0163958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 
246 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
234 aa  52.8  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  32.49 
 
 
302 aa  52.4  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  28.57 
 
 
292 aa  52.4  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.14 
 
 
253 aa  52.4  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0230  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.36 
 
 
261 aa  52.8  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>