More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2073 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
292 aa  580  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.71 
 
 
292 aa  266  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.62 
 
 
287 aa  265  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.62 
 
 
292 aa  246  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0772847  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.83 
 
 
326 aa  245  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.73 
 
 
281 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.244285  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3483  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.73 
 
 
281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.39 
 
 
288 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.39 
 
 
285 aa  237  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000468983  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.15 
 
 
286 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.89 
 
 
284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.1 
 
 
349 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216927  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.79 
 
 
289 aa  209  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 
279 aa  205  7e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09140  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  46.95 
 
 
272 aa  201  9e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.91 
 
 
277 aa  199  5e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.22 
 
 
297 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.580908  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.1 
 
 
296 aa  192  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.95 
 
 
309 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.46 
 
 
288 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.685413  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
278 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
278 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
278 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.29 
 
 
284 aa  183  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2983  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 
291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.888321  normal  0.289512 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.16 
 
 
273 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00939747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 
288 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.512596 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  39.45 
 
 
316 aa  178  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.36 
 
 
281 aa  179  7e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.64 
 
 
290 aa  178  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.29 
 
 
290 aa  176  5e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108282  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  40.07 
 
 
305 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
312 aa  172  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7223  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
274 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109906  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
280 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824425  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.57 
 
 
312 aa  169  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  39.31 
 
 
311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 
304 aa  166  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
313 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.01 
 
 
292 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00870669  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  38.03 
 
 
300 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
298 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  38.03 
 
 
300 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  37.59 
 
 
300 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5377  putative retinol dehydrogenase  40.66 
 
 
296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.637386  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05400  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  37.91 
 
 
274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  37.72 
 
 
300 aa  162  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.86 
 
 
312 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1955  putative short-chain dehydrogenase  40.21 
 
 
598 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00955158  hitchhiker  0.00174251 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  39.24 
 
 
301 aa  157  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  38.28 
 
 
306 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  38.28 
 
 
306 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  38.38 
 
 
303 aa  157  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.2 
 
 
301 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 
338 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  36.18 
 
 
317 aa  156  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
326 aa  156  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
307 aa  155  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.14 
 
 
298 aa  155  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 
271 aa  155  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.173693  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  37.93 
 
 
306 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  39.66 
 
 
292 aa  153  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  37.15 
 
 
302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.88 
 
 
313 aa  152  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 
303 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  38.36 
 
 
308 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.37 
 
 
328 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0363  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  42 
 
 
273 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.177062  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 
340 aa  149  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00109277  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
282 aa  149  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178945  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.1 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  36.36 
 
 
333 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.7 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  36.36 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.01 
 
 
312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863347  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 
297 aa  146  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  37.72 
 
 
306 aa  145  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
307 aa  145  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
308 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
298 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.87 
 
 
271 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.97 
 
 
307 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.97 
 
 
303 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.67 
 
 
318 aa  142  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  37.46 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.278197 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  32.87 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  35.79 
 
 
284 aa  141  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
326 aa  138  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
328 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
278 aa  138  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.207273  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  31.93 
 
 
309 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>