More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5377 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5377  putative retinol dehydrogenase  100 
 
 		 296 aa  587  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.637386  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.73 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.41 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.244285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 		 286 aa  156  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3483  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.68 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.74 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.55 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00109277  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216927  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2983  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.888321  normal  0.289512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.580908  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0772847  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 		 326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 		 280 aa  125  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.96 
 
 		 269 aa  125  8.000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.278197 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 		 284 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 		 292 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00870669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.56 
 
 		 289 aa  122  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.28 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178945  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 		 304 aa  119  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  36.11 
 
 		 300 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  36.86 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.21 
 
 		 290 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1955  putative short-chain dehydrogenase  34.29 
 
 		 598 aa  119  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00955158  hitchhiker  0.00174251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  36.3 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  34.95 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  34.71 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  36.05 
 
 		 302 aa  116  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  35.76 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  35.76 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05400  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  38.19 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 		 277 aa  113  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.512596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 		 284 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.57 
 
 		 328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.84 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09140  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  35.04 
 
 		 272 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.8 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 		 285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000468983  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.1 
 
 		 288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 		 273 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00939747 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  33.9 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  32.88 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  32.88 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.78 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  32.78 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  32.88 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  32.78 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  37.14 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  31 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 		 278 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.207273  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30578  predicted protein  32.38 
 
 		 352 aa  107  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 		 305 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 		 288 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.383399 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  31.07 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.78 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.11 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.57 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  25.27 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 301 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.87 
 
 		 289 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.87 
 
 		 289 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.87 
 
 		 289 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  30.8 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 		 317 aa  102  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  30 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  28.42 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 		 297 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.87 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  32.23 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  29.76 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.06 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  32.29 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2959  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.64 
 
 		 271 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.173693  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 295 aa  99.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.79 
 
 		 298 aa  99.4  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 		 288 aa  99.4  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.685413  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 		 326 aa  99  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  32.23 
 
 		 301 aa  99  9e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.01 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>