More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0498 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
250 aa  501  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0163958 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0814  putative short-chain dehydrogenase/reductase  50.61 
 
 
257 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.968056 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.09 
 
 
245 aa  223  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2677  putative short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  46 
 
 
245 aa  208  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334903  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 
244 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120829  normal  0.282186 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 
237 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
238 aa  178  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2801  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
248 aa  176  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 
244 aa  175  8e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
238 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035289  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 
239 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 
244 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
248 aa  169  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 
241 aa  169  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409582  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
241 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 
233 aa  166  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 
229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7619  short chain oxidoreductase  43.78 
 
 
244 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493234  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 
246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 
270 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.83 
 
 
246 aa  160  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
239 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
272 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
265 aa  159  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.729821 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  39.92 
 
 
240 aa  157  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
252 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
260 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
263 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230027  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
246 aa  146  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
245 aa  145  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
236 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
257 aa  145  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
250 aa  145  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0227742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
251 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  normal  0.454063 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
229 aa  141  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
237 aa  139  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
247 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5116  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
236 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
240 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  decreased coverage  0.000126478 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
235 aa  125  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01679  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase  36.55 
 
 
242 aa  122  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02369  short chain dehydrogenase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15350)  36.07 
 
 
309 aa  119  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.406317 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 
234 aa  119  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 
234 aa  119  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1616  short chain dehydrogenase  30.2 
 
 
236 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124879  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
243 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1818  short chain dehydrogenase  30.2 
 
 
236 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3562  short chain dehydrogenase  31.17 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1782  short chain dehydrogenase  31.45 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.612268  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
284 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.27 
 
 
232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.24 
 
 
249 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  34.27 
 
 
252 aa  109  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
236 aa  108  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0167749  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
237 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
231 aa  106  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 
349 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216927  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2263  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.81 
 
 
249 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412485  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  34.44 
 
 
232 aa  105  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
254 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
254 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0485  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.56 
 
 
249 aa  105  7e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.334807  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 
253 aa  105  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.85 
 
 
249 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07268  short chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00840)  34.12 
 
 
245 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.886513 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  38.05 
 
 
255 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.53 
 
 
251 aa  103  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
246 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
256 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1671  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.57 
 
 
246 aa  102  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 
257 aa  102  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.56 
 
 
257 aa  102  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0830  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.88 
 
 
249 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 
261 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0761637  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.86 
 
 
276 aa  100  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 
249 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.956154 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.31 
 
 
253 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00663805  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1867  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.5 
 
 
247 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0330312  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
250 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0445  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.11 
 
 
246 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
246 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0420142  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37020  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  38.07 
 
 
279 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6325  putative short-chain dehydrogenase  34.47 
 
 
260 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0452  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.11 
 
 
255 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
259 aa  99.8  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0794985  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
249 aa  99.4  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875683  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.33 
 
 
242 aa  99  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00878668  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1474  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  32.41 
 
 
246 aa  99  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.45819  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  33.19 
 
 
247 aa  98.6  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04792  short chain dehydrogenase  52.58 
 
 
110 aa  98.6  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132046  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72880  putative short-chain dehydrogenase  35.51 
 
 
260 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0917  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.86 
 
 
249 aa  98.6  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.213986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>